More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3025 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 371 aa  759    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  84.43 
 
 		 371 aa  619  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  78.17 
 
 		 371 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  78.17 
 
 		 371 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  78.17 
 
 		 371 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  77.63 
 
 		 372 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  77.63 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  77.24 
 
 		 378 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  74.79 
 
 		 367 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  71.78 
 
 		 369 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  70.17 
 
 		 373 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  70.44 
 
 		 373 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  70.14 
 
 		 368 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  68.49 
 
 		 370 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  66.03 
 
 		 368 aa  504  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  65.85 
 
 		 367 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  65.66 
 
 		 372 aa  494  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  65.46 
 
 		 378 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  64.38 
 
 		 374 aa  481  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  64.54 
 
 		 378 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  63.48 
 
 		 375 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  64.64 
 
 		 371 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  63.34 
 
 		 369 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  63.26 
 
 		 372 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  63.09 
 
 		 369 aa  471  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  63.81 
 
 		 371 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  62.64 
 
 		 371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  61.6 
 
 		 371 aa  464  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  60.27 
 
 		 370 aa  461  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  61.33 
 
 		 373 aa  461  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  61.88 
 
 		 370 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  62.64 
 
 		 372 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  64.92 
 
 		 376 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  65.01 
 
 		 375 aa  454  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  61.2 
 
 		 366 aa  441  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  58.54 
 
 		 378 aa  440  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  58.45 
 
 		 374 aa  423  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  60.66 
 
 		 386 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  49.31 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.11 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  46.26 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.49 
 
 		 366 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  45.21 
 
 		 367 aa  335  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.6 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.24 
 
 		 372 aa  333  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  45.13 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.15 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  45.41 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  47.47 
 
 		 369 aa  326  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.26 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  44.57 
 
 		 364 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.26 
 
 		 356 aa  323  4e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.93 
 
 		 367 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.43 
 
 		 378 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.11 
 
 		 366 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  47.71 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  47.44 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  45.07 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  45.55 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  48.96 
 
 		 357 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  43.37 
 
 		 369 aa  319  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.04 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  44.35 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 330 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  47.69 
 
 		 341 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  44.74 
 
 		 375 aa  316  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  44.13 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  44.17 
 
 		 376 aa  315  9e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 375 aa  315  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.69 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.05 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  48.1 
 
 		 356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 344 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  44.85 
 
 		 374 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.5 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  52.08 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  47.32 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  46.72 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  43.95 
 
 		 375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  46.3 
 
 		 374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.61 
 
 		 372 aa  309  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  42.78 
 
 		 380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  50.64 
 
 		 317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  43.05 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  46.01 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  46.4 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  43.59 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  47.43 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  44.17 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  42.51 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  45.2 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  48.93 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  44.65 
 
 		 376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  46.86 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>