More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13122 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  88.14 
 
 		 372 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  88.68 
 
 		 371 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 378 aa  768    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  88.68 
 
 		 371 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  88.68 
 
 		 368 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  88.41 
 
 		 371 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  76.82 
 
 		 371 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  80.17 
 
 		 371 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  73.22 
 
 		 367 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  70.99 
 
 		 369 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  71.51 
 
 		 368 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  69.11 
 
 		 373 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  68.29 
 
 		 373 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  72.83 
 
 		 370 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  69.23 
 
 		 367 aa  511  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  66.85 
 
 		 368 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  66.31 
 
 		 378 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  66.58 
 
 		 372 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  66.39 
 
 		 374 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  65.23 
 
 		 378 aa  494  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  65.94 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  62.93 
 
 		 375 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  64.29 
 
 		 369 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  64.85 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  64.92 
 
 		 371 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  63.22 
 
 		 372 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  66.67 
 
 		 369 aa  478  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  63.26 
 
 		 371 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  62.85 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  64.09 
 
 		 370 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  67.22 
 
 		 375 aa  471  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  62.53 
 
 		 372 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  61.54 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  65.21 
 
 		 366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  64.85 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  58.82 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  59.6 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  64.11 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.37 
 
 		 366 aa  345  8e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  48.7 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  48.41 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.38 
 
 		 383 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  49.42 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.28 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  49.01 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.37 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 		 372 aa  322  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.28 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  51.78 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.44 
 
 		 373 aa  319  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.67 
 
 		 356 aa  318  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 		 357 aa  318  9e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.81 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  46.09 
 
 		 376 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  45.28 
 
 		 368 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  46.41 
 
 		 376 aa  315  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  45.91 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.99 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  46.46 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.56 
 
 		 364 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  43.54 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  44.19 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 330 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  45.98 
 
 		 376 aa  309  6.999999999999999e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.94 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.74 
 
 		 372 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  53.02 
 
 		 317 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  47.28 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  52.06 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  45.2 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  45.58 
 
 		 375 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  46.7 
 
 		 349 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.56 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  47.03 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 330 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  46.81 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  47.93 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  44.26 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  41.69 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  46.86 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0604  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.05 
 
 		 365 aa  299  4e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  46 
 
 		 376 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  46.57 
 
 		 361 aa  299  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  45.53 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.35 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  45.65 
 
 		 332 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>