More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0604 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0604  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  100 
 
 		 365 aa  750    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  59.89 
 
 		 366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0350  peptide chain release factor 2  59.52 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  51.93 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  51.38 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  50.55 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  50.28 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  51.23 
 
 		 376 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  52.06 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  49.73 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  49.73 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  49.73 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  50.55 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 367 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  54.84 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  50.96 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  54.15 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  51.27 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  50.71 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  50.14 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 		 323 aa  362  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  48.87 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50 
 
 		 365 aa  359  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  50.14 
 
 		 365 aa  358  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 365 aa  358  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  51.92 
 
 		 349 aa  355  5e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  52.92 
 
 		 321 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 		 354 aa  355  8.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  53.19 
 
 		 332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.12 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.02 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.73 
 
 		 364 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  51.7 
 
 		 331 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  52.41 
 
 		 322 aa  350  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  53.23 
 
 		 342 aa  349  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 		 375 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 354 aa  349  4e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.9 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  50.99 
 
 		 366 aa  347  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  52.92 
 
 		 321 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  54.02 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.03 
 
 		 372 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  47.31 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  47.47 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  51.77 
 
 		 322 aa  346  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  48.2 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  47.59 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  47.59 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.18 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  52.73 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  52.43 
 
 		 321 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  48.31 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  48.6 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  51.13 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  48.19 
 
 		 372 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3420  hypothetical protein  48.9 
 
 		 365 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 369 aa  343  4e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.33 
 
 		 373 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  52.73 
 
 		 322 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  47.31 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.18 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 391 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 391 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3615  peptide chain release factor 2  50.44 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  52.92 
 
 		 321 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3297  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 352 aa  338  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 406 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  48.02 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3128  peptide chain release factor 2  51.33 
 
 		 352 aa  338  9e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0150596  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  48.62 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  50.8 
 
 		 322 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3492  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0872  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.59 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0826  peptide chain release factor 2  49.26 
 
 		 352 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0335049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>