More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0944 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  100 
 
 
367 aa  745    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  75.27 
 
 
368 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  76.02 
 
 
368 aa  567  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  75.41 
 
 
369 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  75.07 
 
 
368 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  73.91 
 
 
372 aa  551  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  73.91 
 
 
371 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  73.91 
 
 
371 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  73.91 
 
 
371 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  73.84 
 
 
371 aa  541  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  72.25 
 
 
367 aa  542  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  72.05 
 
 
373 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  71.9 
 
 
373 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  72.68 
 
 
370 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  71.31 
 
 
378 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  72.33 
 
 
371 aa  524  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  69.4 
 
 
372 aa  524  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  68.85 
 
 
378 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 
375 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  68.12 
 
 
374 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  68.32 
 
 
371 aa  512  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 
372 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  67.3 
 
 
371 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  72.13 
 
 
378 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  67.95 
 
 
369 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  67.21 
 
 
370 aa  501  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  69.1 
 
 
369 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  65.57 
 
 
371 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  67.95 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  66.39 
 
 
372 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  62.91 
 
 
371 aa  481  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  63.49 
 
 
373 aa  482  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  63.09 
 
 
370 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 
376 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  65.38 
 
 
366 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  60.66 
 
 
378 aa  461  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  59.56 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  65.11 
 
 
386 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 
366 aa  357  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.91 
 
 
367 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  50 
 
 
367 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.69 
 
 
372 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  46.81 
 
 
383 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.63 
 
 
366 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.74 
 
 
362 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 
366 aa  334  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.96 
 
 
377 aa  333  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 
369 aa  334  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 
364 aa  332  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.52 
 
 
367 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.89 
 
 
372 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.77 
 
 
357 aa  328  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.53 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 
369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  45.11 
 
 
368 aa  326  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.43 
 
 
364 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  45 
 
 
376 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.31 
 
 
371 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 
356 aa  322  8e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 
356 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  44.69 
 
 
367 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 
369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  46.24 
 
 
365 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  48.52 
 
 
375 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  46.24 
 
 
375 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.61 
 
 
362 aa  316  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  49.14 
 
 
378 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  45 
 
 
375 aa  316  4e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  43.21 
 
 
380 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  46.13 
 
 
372 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  45.32 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  46.4 
 
 
361 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  43.21 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 
380 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  43.21 
 
 
380 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  45.86 
 
 
374 aa  310  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  47.68 
 
 
341 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  43.7 
 
 
367 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  43.61 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  47.97 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  46.6 
 
 
329 aa  306  3e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  46.71 
 
 
332 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  44.67 
 
 
364 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  44.48 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  46.32 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  43.94 
 
 
367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 
372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  43.67 
 
 
367 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  44.63 
 
 
369 aa  302  7.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  43.64 
 
 
366 aa  301  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  49.25 
 
 
337 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  45.29 
 
 
354 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>