More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2138 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  99.45 
 
 		 362 aa  739    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 364 aa  748    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  60.29 
 
 		 373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  58.4 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  58.89 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  57.58 
 
 		 380 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  57.3 
 
 		 380 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  57.3 
 
 		 380 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  57.3 
 
 		 380 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  56.04 
 
 		 367 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  56.04 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  59.57 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  56.78 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  53.7 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  59.26 
 
 		 326 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  59.57 
 
 		 326 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  59.57 
 
 		 326 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  53.57 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  53.98 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  60.56 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  58.33 
 
 		 326 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  54.42 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  53.31 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  57.45 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  52.41 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  58.72 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  55.11 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  58.39 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  51.11 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  55.17 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  52.26 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 		 375 aa  371  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  49 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  54.79 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  51.94 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  51.91 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  46.58 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  53.42 
 
 		 332 aa  362  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 		 326 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 333 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  47.72 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  46.96 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  48.19 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.5 
 
 		 371 aa  349  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.29 
 
 		 378 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 		 312 aa  349  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  47.34 
 
 		 372 aa  348  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  54.92 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  48.07 
 
 		 371 aa  345  7e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  48.52 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 		 329 aa  342  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 365 aa  342  5e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  51.74 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.58 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  47.86 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  48.87 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.74 
 
 		 378 aa  338  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  48.83 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 379 aa  337  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50.45 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 		 372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  46.48 
 
 		 378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  48.28 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.48 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  45.92 
 
 		 371 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  49.1 
 
 		 364 aa  335  9e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  52.03 
 
 		 317 aa  335  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  46.3 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  49.43 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  46.56 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 367 aa  332  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  48.38 
 
 		 356 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1767  peptide chain release factor 2  52.25 
 
 		 337 aa  332  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 343 aa  332  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  47.58 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  46 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  46.32 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  46.58 
 
 		 459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.05 
 
 		 365 aa  328  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.05 
 
 		 365 aa  328  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>