More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2124 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 356 aa  724    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  89.61 
 
 		 356 aa  662    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  79.21 
 
 		 356 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27381  peptide chain release factor 2  85.89 
 
 		 319 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  72.05 
 
 		 354 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  71.47 
 
 		 354 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  71.76 
 
 		 354 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  78.14 
 
 		 313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  78.78 
 
 		 313 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  71.8 
 
 		 361 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02091  peptide chain release factor 2  70.89 
 
 		 354 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  71.47 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  71.47 
 
 		 365 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  69.57 
 
 		 360 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  72.01 
 
 		 304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  75.44 
 
 		 292 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2120  peptide chain release factor 2  74.73 
 
 		 288 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.56 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  51.18 
 
 		 383 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.44 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  48.67 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.83 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.67 
 
 		 373 aa  342  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  51.34 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  51.61 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.67 
 
 		 362 aa  335  7e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  49.27 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.38 
 
 		 364 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  50.88 
 
 		 367 aa  332  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 		 373 aa  332  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.27 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 378 aa  332  8e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  51.53 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  50.74 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  59.41 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  50.77 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  51.2 
 
 		 371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 378 aa  329  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 368 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  48.7 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  48.54 
 
 		 367 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  49.13 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  49.13 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  49.54 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  48.84 
 
 		 371 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 370 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  50.29 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 374 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  46.09 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 332 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46.04 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  45.3 
 
 		 367 aa  322  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 367 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.54 
 
 		 357 aa  322  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  48.67 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  46.09 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  45.8 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  45.64 
 
 		 369 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  45.51 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 		 368 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 326 aa  318  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 326 aa  318  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  45.24 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.87 
 
 		 375 aa  316  3e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.56 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  46.93 
 
 		 331 aa  316  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 371 aa  315  9e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.97 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 		 372 aa  315  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  45.75 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  48.91 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  46.79 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  48 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  47.83 
 
 		 376 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  47.32 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 372 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>