More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1330 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  100 
 
 		 332 aa  690    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  60.37 
 
 		 367 aa  427  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  62.24 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  57.89 
 
 		 380 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  57.19 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  57.89 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  58.82 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  56.02 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  55.18 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  55.02 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  53.5 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  53.61 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  54.35 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  54.83 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  54.94 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  53.23 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  55.14 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  53.42 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  53.42 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  52.92 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  55.18 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 		 366 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  55.42 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  53.4 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  52.55 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  54.52 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  53.64 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  51.57 
 
 		 366 aa  360  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 367 aa  352  5e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 343 aa  348  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  49.23 
 
 		 377 aa  348  7e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 		 366 aa  347  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 334 aa  345  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.48 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 		 371 aa  342  5e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.31 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  49.38 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 		 375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  48.31 
 
 		 371 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.3 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  49.25 
 
 		 376 aa  331  8e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  50.98 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  51.07 
 
 		 333 aa  328  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  47.58 
 
 		 369 aa  328  7e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 374 aa  328  8e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 		 372 aa  328  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  53.7 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  48.5 
 
 		 371 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  47.52 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  46.32 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 361 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 375 aa  325  7e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  49.22 
 
 		 362 aa  323  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 		 312 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  52.82 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 369 aa  322  6e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  47.5 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1999  peptide chain release factor 2  47.56 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.285694  hitchhiker  0.0000104835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  46.5 
 
 		 376 aa  318  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  45.96 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  47.99 
 
 		 361 aa  319  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  47.56 
 
 		 376 aa  318  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.5 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  47.37 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.12 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  45.03 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  46.6 
 
 		 356 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 		 375 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 369 aa  315  9e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  48.44 
 
 		 376 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  45.87 
 
 		 368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  47.56 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  44.92 
 
 		 369 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>