More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1805 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 358 aa  733    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  72.21 
 
 		 376 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  65.27 
 
 		 370 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  74.59 
 
 		 310 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  65.87 
 
 		 371 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  65.79 
 
 		 369 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.88 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.16 
 
 		 383 aa  355  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 379 aa  352  7e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.86 
 
 		 372 aa  349  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.14 
 
 		 377 aa  348  6e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  49.71 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 380 aa  345  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 380 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  58.57 
 
 		 312 aa  342  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 380 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  48.57 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.71 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  50.63 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  49.71 
 
 		 365 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  50.3 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 374 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.14 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  46.99 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  46.57 
 
 		 369 aa  334  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  50.15 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  48.82 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.83 
 
 		 371 aa  331  9e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.05 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  46.5 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.65 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  47.45 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.13 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  48.25 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  47.13 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  48.86 
 
 		 376 aa  328  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  48.84 
 
 		 361 aa  328  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 375 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 		 376 aa  326  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  48.13 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  47.65 
 
 		 365 aa  326  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 		 331 aa  325  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3050  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 352 aa  325  9e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  49.67 
 
 		 332 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  47.93 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  48.04 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 417 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0826  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 352 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0335049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3197  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 352 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.710234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3297  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  48.13 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  48.13 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  47.52 
 
 		 332 aa  322  4e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 354 aa  322  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  48.49 
 
 		 344 aa  322  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.14 
 
 		 325 aa  322  7e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 326 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 		 349 aa  322  8e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  48.09 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  44.01 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  49.39 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  46.46 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  47.09 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  48.09 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.35 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 321 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  48.09 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  49.27 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  48.09 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3615  peptide chain release factor 2  46.72 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  49.7 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 		 459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  51.66 
 
 		 323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 391 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>