More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1302 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  83.12 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  75.33 
 
 		 358 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  70.36 
 
 		 370 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  65.36 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  64.59 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  55.67 
 
 		 372 aa  340  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  56.63 
 
 		 366 aa  338  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  57.45 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50.81 
 
 		 332 aa  332  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.85 
 
 		 383 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  55.07 
 
 		 377 aa  329  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  54.64 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  54.83 
 
 		 380 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 380 aa  326  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  54.48 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  54.48 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 327 aa  325  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  55.28 
 
 		 367 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  54.9 
 
 		 343 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  54.48 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  54.48 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  54.48 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  53.9 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  52.01 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  52.82 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  54.36 
 
 		 366 aa  322  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  52.81 
 
 		 369 aa  322  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  53.38 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.81 
 
 		 331 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  54.61 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  55.12 
 
 		 326 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  53.38 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  53.31 
 
 		 374 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  55 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 		 367 aa  316  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 		 367 aa  315  5e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 323 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  51.32 
 
 		 371 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  50.5 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  52.52 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  56.69 
 
 		 371 aa  311  6.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  52.63 
 
 		 367 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  52.35 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  57.03 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  53.04 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  52.8 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  48.5 
 
 		 367 aa  308  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  50.17 
 
 		 369 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  52.08 
 
 		 365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  52.8 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  49.67 
 
 		 375 aa  305  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  54.65 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.32 
 
 		 340 aa  305  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 		 321 aa  305  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  49.67 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.56 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  49.35 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.8 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  50.49 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  56.18 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  49.83 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  52.03 
 
 		 321 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  52.03 
 
 		 321 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  52.36 
 
 		 376 aa  302  5.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  50.68 
 
 		 375 aa  302  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 		 299 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  48.5 
 
 		 372 aa  301  6.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  53.28 
 
 		 361 aa  301  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  51.35 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  51.35 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  51.35 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  54.65 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0049  peptide chain release factor 2  51.05 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  51.35 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  51.67 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  58.78 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  50.33 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  51.35 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.01 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  51.01 
 
 		 321 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  49.66 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  51.57 
 
 		 332 aa  298  6e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  54.28 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.96 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  51.03 
 
 		 356 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1628  peptide chain release factor 2  51.55 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  53.04 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  51.8 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  52.86 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  49.66 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>