More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0194 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  83.61 
 
 		 365 aa  529  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  82.61 
 
 		 365 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  81.94 
 
 		 365 aa  527  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  81.27 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  82.49 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  82.27 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  81.27 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  81.27 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  81.27 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  82.49 
 
 		 310 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  80.94 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004438  peptide chain release factor 2  95 
 
 		 260 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00959  hypothetical protein  93.46 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  79.26 
 
 		 329 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0811  peptide chain release factor 2  78.5 
 
 		 293 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3297  peptide chain release factor 2  79.8 
 
 		 352 aa  497  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  80.94 
 
 		 364 aa  497  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0826  peptide chain release factor 2  78.6 
 
 		 352 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0335049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3197  peptide chain release factor 2  78.6 
 
 		 352 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.710234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3050  peptide chain release factor 2  78.79 
 
 		 352 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3615  peptide chain release factor 2  77.78 
 
 		 352 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3492  peptide chain release factor 2  77.78 
 
 		 352 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0872  peptide chain release factor 2  77.78 
 
 		 352 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3420  hypothetical protein  77.78 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0756  peptide chain release factor 2  75.43 
 
 		 293 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.393199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3128  peptide chain release factor 2  76.43 
 
 		 352 aa  480  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0150596  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  76.09 
 
 		 365 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  73.91 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0582  peptide chain release factor 2  74.41 
 
 		 320 aa  474  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0840  peptide chain release factor 2  75.42 
 
 		 352 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02770  Protein chain release factor B, RF-2  80.85 
 
 		 282 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0501014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  72.73 
 
 		 310 aa  461  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  73.4 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  71.96 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1476  peptide chain release factor 2  82.31 
 
 		 260 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0780074  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  70.37 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1360  peptide chain release factor 2  76.59 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  68.56 
 
 		 304 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  73.08 
 
 		 331 aa  441  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  67.89 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  69.57 
 
 		 378 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  67.89 
 
 		 325 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  68.9 
 
 		 349 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  69.23 
 
 		 332 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1742  hypothetical protein  74.2 
 
 		 335 aa  434  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  68.23 
 
 		 349 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  69.57 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39400  peptide chain release factor 2  71.79 
 
 		 280 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1742  hypothetical protein  74.2 
 
 		 335 aa  431  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  66.89 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  68.23 
 
 		 354 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  68.23 
 
 		 382 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0049  peptide chain release factor 2  69.66 
 
 		 291 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  68.9 
 
 		 304 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  69.23 
 
 		 365 aa  424  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1500  hypothetical protein  67.24 
 
 		 293 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  69.31 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  67.34 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  68.62 
 
 		 329 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  67.89 
 
 		 354 aa  417  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  63.85 
 
 		 365 aa  417  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1059  peptide chain release factor 2  68.57 
 
 		 280 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304083  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  67.24 
 
 		 302 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  67.24 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  65.32 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  64.65 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  62.84 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  62.63 
 
 		 459 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  64.31 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  62.96 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  62.96 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  62.96 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  65.02 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  62.29 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  60.87 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  62.33 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  62.29 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  61.95 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  62.29 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  62 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  61.62 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  63.51 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  63.85 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  62.21 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  60.14 
 
 		 417 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1645  peptide chain release factor 2  65.96 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1766  peptide chain release factor 2  61.82 
 
 		 300 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015531 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  59.26 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  59.6 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  62.14 
 
 		 280 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  60.61 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  61.28 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  59.93 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  60.61 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  60.14 
 
 		 347 aa  377  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  60.61 
 
 		 300 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  67.34 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  67.74 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  67.74 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>