More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0863 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  753    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  86.03 
 
 		 372 aa  640    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  82.32 
 
 		 371 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  81.82 
 
 		 370 aa  609  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  80 
 
 		 374 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  78.89 
 
 		 371 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  75.41 
 
 		 370 aa  577  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  77.22 
 
 		 371 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  74.79 
 
 		 371 aa  570  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  75.49 
 
 		 373 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  70.25 
 
 		 367 aa  534  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  67.77 
 
 		 378 aa  521  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  67.96 
 
 		 373 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  67.21 
 
 		 368 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  67.13 
 
 		 373 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  69.21 
 
 		 370 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  67.95 
 
 		 367 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  67.03 
 
 		 371 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  68.32 
 
 		 374 aa  502  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  67.03 
 
 		 371 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  67.03 
 
 		 371 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  67.66 
 
 		 369 aa  501  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  66.57 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  64.75 
 
 		 372 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  69.53 
 
 		 375 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  63.29 
 
 		 372 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  63.84 
 
 		 368 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  62.09 
 
 		 375 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  61.41 
 
 		 378 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  63.84 
 
 		 378 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  63.07 
 
 		 371 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  65.7 
 
 		 369 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  62.53 
 
 		 371 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  60.76 
 
 		 372 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  64.74 
 
 		 376 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  63.74 
 
 		 378 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  60.27 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  60.76 
 
 		 386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.83 
 
 		 383 aa  339  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.35 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.08 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  46.29 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  46.24 
 
 		 367 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 369 aa  325  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  42.46 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  43.18 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.76 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  44.96 
 
 		 366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.53 
 
 		 377 aa  319  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 		 375 aa  319  6e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  44.85 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.24 
 
 		 367 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 		 357 aa  315  8e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 374 aa  315  8e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 356 aa  315  8e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  44.78 
 
 		 357 aa  315  9e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 369 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  42.65 
 
 		 373 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.63 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.07 
 
 		 330 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  45.38 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  45.61 
 
 		 364 aa  308  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 		 337 aa  308  9e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  42.22 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  46.86 
 
 		 378 aa  305  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  47.85 
 
 		 372 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 317 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  45.26 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  45.79 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  45.35 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  44.29 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  44.29 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  41.35 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  43.65 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  43.3 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 		 374 aa  299  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  45.54 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  45.32 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  41.89 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  43.71 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  45.68 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  48.14 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  44 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  41 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 360 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  41.81 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  45.85 
 
 		 332 aa  294  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  46.49 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  43.7 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>