More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2784 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  87.05 
 
 		 363 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 363 aa  751    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  85.4 
 
 		 363 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  88.1 
 
 		 312 aa  579  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  74.24 
 
 		 363 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  75.35 
 
 		 381 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  93.57 
 
 		 249 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  51.73 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  50.71 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  52.46 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  51.16 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.57 
 
 		 364 aa  348  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  48.84 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.27 
 
 		 371 aa  342  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 357 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 372 aa  341  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.15 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.55 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  48.84 
 
 		 367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  51.03 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  49.57 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.24 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  49.13 
 
 		 361 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  50.73 
 
 		 371 aa  332  8e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  47.66 
 
 		 349 aa  329  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  47.14 
 
 		 354 aa  328  9e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 330 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 380 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 		 349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  47.52 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  48.41 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 		 380 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  47.52 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.8 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  48.53 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.23 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  49.09 
 
 		 340 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  45.64 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  45.64 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  45.64 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  45.64 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  47.49 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 367 aa  322  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  46.27 
 
 		 332 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  46.61 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.54 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  46.02 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.79 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  49.22 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  45.35 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.75 
 
 		 362 aa  318  6e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 357 aa  318  7e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  45.91 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  46.52 
 
 		 417 aa  318  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 326 aa  318  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 326 aa  318  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 326 aa  318  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  46.82 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 326 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  49.56 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  49 
 
 		 374 aa  315  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  44.67 
 
 		 382 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  45.03 
 
 		 406 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  45.68 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  45.75 
 
 		 459 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  47.54 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  45.72 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  45.75 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 		 325 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  45.61 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  45.75 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  52.11 
 
 		 304 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  51.76 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  53.24 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>