More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2432 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  60.06 
 
 		 641 aa  675    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  66.38 
 
 		 583 aa  677    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  65.71 
 
 		 595 aa  674    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  60.83 
 
 		 618 aa  638    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 589 aa  1133    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  35.09 
 
 		 719 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.6 
 
 		 664 aa  158  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  38.2 
 
 		 700 aa  153  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.86 
 
 		 678 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.17 
 
 		 688 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.77 
 
 		 694 aa  134  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.61 
 
 		 739 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.93 
 
 		 665 aa  115  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  26.5 
 
 		 863 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  28.94 
 
 		 927 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.2 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 892 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  23.44 
 
 		 828 aa  65.1  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  29.82 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  23.45 
 
 		 793 aa  64.7  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.08 
 
 		 547 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  23.42 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  27.5 
 
 		 778 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  35.11 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.33 
 
 		 796 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6754  predicted protein  31.96 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  31.48 
 
 		 1186 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  26.84 
 
 		 791 aa  62  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  23.49 
 
 		 863 aa  61.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  29.23 
 
 		 893 aa  61.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  30.77 
 
 		 784 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  30.41 
 
 		 785 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  28.14 
 
 		 797 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  24.41 
 
 		 874 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  30.9 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 761 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  20.97 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.05 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.93 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  30.52 
 
 		 872 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  27.94 
 
 		 812 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.08 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  31.76 
 
 		 765 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  33.57 
 
 		 865 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.03 
 
 		 771 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.59 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.15 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  20.83 
 
 		 848 aa  58.9  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.95 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  32.58 
 
 		 750 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  28.25 
 
 		 859 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  30.4 
 
 		 910 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 881 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  23.04 
 
 		 823 aa  58.9  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  27.97 
 
 		 872 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  31.74 
 
 		 771 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  28.19 
 
 		 896 aa  57.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05320  meiotic recombination-related protein, putative  27.14 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  24.72 
 
 		 875 aa  57.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  29.9 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  28.38 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.67 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  29.12 
 
 		 898 aa  57.4  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85730  predicted protein  22.88 
 
 		 871 aa  57.4  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.144196 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  28.83 
 
 		 817 aa  57  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 		 891 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  33.88 
 
 		 930 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  29.12 
 
 		 910 aa  57  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  17.73 
 
 		 913 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  31.01 
 
 		 805 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  23.33 
 
 		 867 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.69 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  27.44 
 
 		 910 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.98 
 
 		 723 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  26.59 
 
 		 722 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  26.4 
 
 		 870 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  26.51 
 
 		 905 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  25.46 
 
 		 782 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  36.75 
 
 		 869 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  29.33 
 
 		 786 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  23.19 
 
 		 705 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  29.8 
 
 		 783 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  27.08 
 
 		 825 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.84 
 
 		 798 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  31.17 
 
 		 854 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  29.33 
 
 		 854 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  17.38 
 
 		 913 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  24.93 
 
 		 857 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.51 
 
 		 786 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  33.6 
 
 		 873 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  22.53 
 
 		 804 aa  55.1  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  25.6 
 
 		 928 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  24.39 
 
 		 780 aa  55.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.33 
 
 		 721 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53969  predicted protein  30.09 
 
 		 1423 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  25.51 
 
 		 891 aa  54.7  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  29.19 
 
 		 871 aa  54.7  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  25.13 
 
 		 868 aa  54.7  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  29.14 
 
 		 783 aa  54.3  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>