More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3226 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 
858 aa  688    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  45.55 
 
 
871 aa  721    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
828 aa  664    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 
873 aa  730    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  45.52 
 
 
932 aa  726    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 
897 aa  671    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 
860 aa  651    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 
858 aa  688    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 
868 aa  646    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
850 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 
858 aa  667    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 
900 aa  868    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 
928 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 
869 aa  690    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  55.4 
 
 
864 aa  923    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 
870 aa  724    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 
863 aa  679    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  46.63 
 
 
872 aa  747    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 
870 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  45.54 
 
 
869 aa  754    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 
867 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  44.74 
 
 
863 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 
891 aa  648    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
892 aa  1821    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 
868 aa  699    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
881 aa  684    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
872 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  44.32 
 
 
872 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.28 
 
 
870 aa  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 
862 aa  686    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  50.9 
 
 
887 aa  893    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  54.36 
 
 
874 aa  928    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 
853 aa  719    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  55.02 
 
 
872 aa  922    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  52.79 
 
 
903 aa  867    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 
910 aa  691    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  41.57 
 
 
910 aa  687    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.87 
 
 
896 aa  680    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  43.39 
 
 
859 aa  697    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 
865 aa  678    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  44.31 
 
 
898 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 
880 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.67 
 
 
857 aa  741    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 
889 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 
868 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 
837 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 
872 aa  631  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 
904 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
867 aa  626  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 
894 aa  627  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 
927 aa  628  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  39.22 
 
 
886 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 
875 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 
855 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
903 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 
882 aa  622  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  39.15 
 
 
910 aa  625  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 
863 aa  619  1e-176  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 
855 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 
851 aa  619  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 
896 aa  620  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  38.52 
 
 
869 aa  619  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 
873 aa  617  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.51 
 
 
882 aa  618  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 
881 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 
868 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
905 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 
887 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  40.54 
 
 
872 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
895 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 
930 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 
872 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 
858 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 
873 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  36.59 
 
 
868 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 
871 aa  605  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  38.63 
 
 
890 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 
859 aa  604  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 
871 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 
859 aa  602  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 
863 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 
860 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 
860 aa  600  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
892 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
892 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 
855 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
892 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
890 aa  597  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
894 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  36.35 
 
 
872 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  36.35 
 
 
872 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 
878 aa  598  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 
968 aa  596  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
892 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  39.81 
 
 
855 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 
859 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  39.26 
 
 
892 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 
856 aa  598  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  39.81 
 
 
855 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 
882 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>