More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0412 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  56 
 
 		 881 aa  1014    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 		 872 aa  795    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 896 aa  724    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 		 871 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  48.53 
 
 		 873 aa  806    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 		 848 aa  652    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  49.78 
 
 		 892 aa  862    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  49.88 
 
 		 858 aa  816    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 		 897 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  50.22 
 
 		 892 aa  867    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 		 890 aa  863    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  49.89 
 
 		 894 aa  863    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  40.46 
 
 		 888 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 		 932 aa  689    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  44.59 
 
 		 882 aa  716    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  52.5 
 
 		 860 aa  917    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 853 aa  676    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.28 
 
 		 900 aa  677    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  49.66 
 
 		 892 aa  864    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 		 870 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  41.97 
 
 		 854 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 868 aa  684    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 		 870 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  43.2 
 
 		 863 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 862 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 		 872 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.32 
 
 		 872 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  50.22 
 
 		 892 aa  867    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 		 872 aa  795    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 		 882 aa  657    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.97 
 
 		 863 aa  713    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 		 895 aa  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 869 aa  679    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.99 
 
 		 870 aa  736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  51.87 
 
 		 903 aa  885    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 		 869 aa  714    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40.57 
 
 		 888 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  50.22 
 
 		 892 aa  867    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 		 892 aa  864    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 		 872 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 		 891 aa  673    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 		 850 aa  667    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 887 aa  683    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  43.96 
 
 		 867 aa  720    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 		 868 aa  721    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 885 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 		 910 aa  681    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 910 aa  680    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 901 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 873 aa  703    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 		 890 aa  867    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  43.8 
 
 		 865 aa  686    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.15 
 
 		 859 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  49.55 
 
 		 890 aa  860    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  50.49 
 
 		 840 aa  820    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 857 aa  1770    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  51.22 
 
 		 854 aa  866    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 		 852 aa  856    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 		 880 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 857 aa  654    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.79 
 
 		 858 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  39.32 
 
 		 868 aa  631  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 		 896 aa  631  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 889 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 		 854 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  39.34 
 
 		 837 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.77 
 
 		 858 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 		 881 aa  625  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 858 aa  621  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  38.52 
 
 		 893 aa  617  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  40.24 
 
 		 907 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  39.72 
 
 		 865 aa  615  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  38.19 
 
 		 918 aa  612  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 874 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.04 
 
 		 887 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 		 882 aa  615  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 		 848 aa  608  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 		 828 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 868 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 855 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 		 854 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 		 863 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 872 aa  602  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  38.93 
 
 		 905 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  38.5 
 
 		 904 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 		 910 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 		 872 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 898 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 858 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.87 
 
 		 861 aa  596  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 853 aa  597  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  39.03 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 863 aa  595  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 		 872 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 856 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 		 856 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 858 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 859 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  39.01 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 856 aa  593  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>