More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1181 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  45.32 
 
 		 871 aa  680    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 891 aa  645    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 881 aa  649    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.73 
 
 		 872 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 872 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  54.66 
 
 		 872 aa  949    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 		 896 aa  651    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 		 869 aa  687    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  63.77 
 
 		 905 aa  1135    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 		 900 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 870 aa  684    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 869 aa  669    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  37.98 
 
 		 867 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.98 
 
 		 872 aa  711    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  59.47 
 
 		 904 aa  1069    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 927 aa  1905    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 880 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 932 aa  672    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 870 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  61.4 
 
 		 910 aa  1107    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 863 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  54.14 
 
 		 896 aa  947    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 910 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 910 aa  638    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 873 aa  668    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  43.38 
 
 		 889 aa  693    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 868 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 870 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.01 
 
 		 859 aa  633  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 		 873 aa  631  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 887 aa  632  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 		 868 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 		 857 aa  626  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  37.83 
 
 		 853 aa  625  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 882 aa  623  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.11 
 
 		 872 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  38.11 
 
 		 872 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 837 aa  618  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.38 
 
 		 858 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 		 892 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.2 
 
 		 863 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 859 aa  613  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 		 881 aa  609  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 		 860 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 872 aa  610  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 897 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  39.51 
 
 		 858 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  36.81 
 
 		 868 aa  608  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 903 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 881 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  40.28 
 
 		 858 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 863 aa  601  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 856 aa  602  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 882 aa  601  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 865 aa  601  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 		 863 aa  599  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 855 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 		 859 aa  595  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 		 850 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 		 887 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 862 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 858 aa  595  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 		 889 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  39.53 
 
 		 840 aa  595  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  39.08 
 
 		 883 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 		 862 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  39.36 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  37.21 
 
 		 894 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 898 aa  591  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 		 861 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 		 861 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 878 aa  592  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 861 aa  592  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  37.7 
 
 		 895 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.21 
 
 		 853 aa  592  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.35 
 
 		 861 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  36.91 
 
 		 892 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  37.15 
 
 		 890 aa  588  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  37.07 
 
 		 892 aa  589  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 		 890 aa  588  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  39.21 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 		 857 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 856 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 855 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 856 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.92 
 
 		 874 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  38.67 
 
 		 871 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 854 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 853 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  39.2 
 
 		 859 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 855 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 882 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  38.26 
 
 		 890 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 		 855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 819 aa  581  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>