More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1115 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  45.65 
 
 		 828 aa  640    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  45.3 
 
 		 896 aa  656    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 863 aa  638    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  56.43 
 
 		 823 aa  866    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  57.86 
 
 		 819 aa  904    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  94.83 
 
 		 793 aa  1550    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  47.25 
 
 		 817 aa  717    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 793 aa  1617    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 		 857 aa  653    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.55 
 
 		 870 aa  635  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  45.12 
 
 		 853 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  44.56 
 
 		 862 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  44.22 
 
 		 869 aa  631  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 867 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 		 873 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 		 910 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 887 aa  622  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 903 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.65 
 
 		 882 aa  620  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.55 
 
 		 910 aa  621  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 870 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.8 
 
 		 863 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 900 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 932 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 889 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.63 
 
 		 858 aa  608  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 		 872 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 872 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 		 872 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 860 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.17 
 
 		 859 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 873 aa  599  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 		 865 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 		 872 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 		 871 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  45.75 
 
 		 898 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 858 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 875 aa  594  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 858 aa  590  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 856 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 856 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 		 873 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 850 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 856 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 871 aa  589  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 856 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 872 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  40.17 
 
 		 896 aa  588  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 869 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 		 861 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  43.11 
 
 		 851 aa  587  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 		 874 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 872 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  42.77 
 
 		 897 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.82 
 
 		 868 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 		 861 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 		 861 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 864 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  40.14 
 
 		 928 aa  582  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 862 aa  581  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 881 aa  578  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 860 aa  580  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 868 aa  580  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 859 aa  581  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 868 aa  581  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 878 aa  582  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 894 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  40.46 
 
 		 869 aa  577  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 		 881 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 868 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 823 aa  577  1.0000000000000001e-163  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 858 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 		 904 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 		 859 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 858 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 862 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 868 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 		 882 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 848 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 		 891 aa  577  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 		 865 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 867 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 871 aa  573  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 855 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 884 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 884 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 874 aa  570  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 863 aa  572  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 863 aa  569  1e-161  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 		 854 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 856 aa  570  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 		 910 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 872 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 		 939 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 859 aa  568  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  39.57 
 
 		 893 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 		 939 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  38.48 
 
 		 872 aa  566  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>