More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1202 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 859 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 856 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 		 858 aa  675    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  45.36 
 
 		 871 aa  741    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  65.28 
 
 		 892 aa  1187    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 868 aa  681    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 858 aa  660    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  53.52 
 
 		 873 aa  929    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 854 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  48.76 
 
 		 870 aa  848    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  65.39 
 
 		 892 aa  1186    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  45.28 
 
 		 869 aa  750    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  50.4 
 
 		 858 aa  853    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 823 aa  642    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 891 aa  669    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  64.72 
 
 		 892 aa  1186    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  65.28 
 
 		 892 aa  1188    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  65.43 
 
 		 890 aa  1189    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  65.02 
 
 		 894 aa  1186    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 		 837 aa  708    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  66.52 
 
 		 895 aa  1218    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 		 872 aa  717    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  65.28 
 
 		 892 aa  1189    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  65.54 
 
 		 890 aa  1191    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  48.57 
 
 		 873 aa  818    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.73 
 
 		 900 aa  708    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  46.92 
 
 		 932 aa  760    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 		 874 aa  656    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 		 854 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 		 848 aa  662    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 880 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 		 868 aa  707    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 		 905 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  46.52 
 
 		 870 aa  788    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  48.04 
 
 		 867 aa  806    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  47.38 
 
 		 868 aa  835    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.08 
 
 		 873 aa  638    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  53.06 
 
 		 872 aa  923    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  46.95 
 
 		 872 aa  768    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 		 904 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 871 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  65.28 
 
 		 892 aa  1188    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 862 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  47.97 
 
 		 863 aa  805    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 		 855 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  46.37 
 
 		 863 aa  759    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.01 
 
 		 878 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  46.34 
 
 		 872 aa  758    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 		 892 aa  643    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 860 aa  1764    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  48.72 
 
 		 896 aa  825    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 858 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 862 aa  677    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  47.18 
 
 		 850 aa  753    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  53.06 
 
 		 872 aa  923    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 		 874 aa  662    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  44.94 
 
 		 887 aa  727    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 872 aa  677    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.07 
 
 		 869 aa  780    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.45 
 
 		 882 aa  752    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  46.03 
 
 		 853 aa  736    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 882 aa  658    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  45.28 
 
 		 870 aa  736    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  43.53 
 
 		 858 aa  688    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.65 
 
 		 881 aa  707    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 872 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  74.09 
 
 		 903 aa  1382    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.7 
 
 		 853 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  44.75 
 
 		 910 aa  788    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  47.89 
 
 		 910 aa  786    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 		 896 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 901 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.79 
 
 		 897 aa  801    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.57 
 
 		 861 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44.03 
 
 		 859 aa  731    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  65.32 
 
 		 890 aa  1193    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  47.11 
 
 		 865 aa  758    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  49.71 
 
 		 840 aa  837    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  52.5 
 
 		 857 aa  917    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  50.75 
 
 		 854 aa  845    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  48.39 
 
 		 852 aa  835    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  56.46 
 
 		 881 aa  991    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 857 aa  685    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 889 aa  688    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 		 868 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 		 898 aa  635  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 		 856 aa  635  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  43.84 
 
 		 882 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 		 875 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 885 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 853 aa  634  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 861 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 861 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40.28 
 
 		 888 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 		 860 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 882 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 854 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.7 
 
 		 856 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 861 aa  631  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 		 882 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>