More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1709 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  45.25 
 
 		 869 aa  736    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  49.09 
 
 		 898 aa  778    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 858 aa  657    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 		 858 aa  669    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 871 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.91 
 
 		 823 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 		 891 aa  687    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 		 872 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 		 859 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 853 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 867 aa  671    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 		 872 aa  700    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  66.2 
 
 		 878 aa  1158    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 		 856 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 		 897 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 		 859 aa  637    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 		 863 aa  734    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 881 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 856 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  44.2 
 
 		 896 aa  684    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  72.63 
 
 		 872 aa  1288    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  41.81 
 
 		 856 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 869 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 856 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  73.61 
 
 		 872 aa  1324    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 869 aa  711    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 856 aa  648    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 		 870 aa  695    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 		 856 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  68.66 
 
 		 873 aa  1222    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 872 aa  685    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 853 aa  666    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 864 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 858 aa  648    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  66.86 
 
 		 875 aa  1179    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 		 853 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 853 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 870 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 863 aa  681    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 871 aa  1785    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 868 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 932 aa  705    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  43.85 
 
 		 855 aa  719    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.84 
 
 		 855 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  44.98 
 
 		 886 aa  744    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  42.79 
 
 		 858 aa  682    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  46.06 
 
 		 868 aa  764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 862 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 887 aa  661    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 874 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 		 854 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 891 aa  677    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  45.16 
 
 		 858 aa  731    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 882 aa  662    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.66 
 
 		 870 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 		 859 aa  658    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  43.7 
 
 		 856 aa  725    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 910 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 910 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  46.23 
 
 		 860 aa  754    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  43.38 
 
 		 873 aa  698    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 		 861 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 		 861 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 861 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  43 
 
 		 859 aa  686    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 		 862 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 		 855 aa  674    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 871 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  43.21 
 
 		 862 aa  659    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 		 856 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 		 882 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 857 aa  641    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.8 
 
 		 889 aa  687    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 		 868 aa  685    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.97 
 
 		 861 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 882 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 854 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 882 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 882 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 		 872 aa  635  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 828 aa  634  1e-180  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 		 872 aa  629  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 		 837 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 880 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 		 882 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.57 
 
 		 878 aa  630  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 		 873 aa  627  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 854 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 900 aa  627  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 860 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 		 871 aa  626  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 		 887 aa  627  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 		 889 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 		 855 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 851 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 		 855 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 		 855 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 		 868 aa  624  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  37.4 
 
 		 872 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>