More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1883 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 		 891 aa  678    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.64 
 
 		 858 aa  671    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 871 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.32 
 
 		 896 aa  685    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  53.13 
 
 		 891 aa  980    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  45.72 
 
 		 875 aa  764    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 869 aa  723    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  61.19 
 
 		 864 aa  1092    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 928 aa  648    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 858 aa  1765    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  58.04 
 
 		 863 aa  1043    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  45.52 
 
 		 872 aa  729    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  45.2 
 
 		 878 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.04 
 
 		 870 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  45.45 
 
 		 873 aa  733    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.63 
 
 		 872 aa  727    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  61.12 
 
 		 868 aa  1090    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 869 aa  670    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  45.21 
 
 		 872 aa  740    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 873 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  61.92 
 
 		 869 aa  1101    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 870 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.63 
 
 		 858 aa  671    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.1 
 
 		 872 aa  686    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.93 
 
 		 887 aa  674    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 		 872 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 872 aa  638    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 870 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  62.1 
 
 		 886 aa  1112    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 		 932 aa  658    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 882 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 860 aa  641    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.64 
 
 		 858 aa  679    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 862 aa  671    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  45.16 
 
 		 871 aa  731    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  60.72 
 
 		 856 aa  1099    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  59.67 
 
 		 860 aa  1055    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.95 
 
 		 859 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 837 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  51.1 
 
 		 898 aa  850    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 		 894 aa  639    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  61.8 
 
 		 855 aa  1102    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 889 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 823 aa  634  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 863 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 900 aa  632  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 		 867 aa  635  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 		 857 aa  635  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 868 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 881 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 		 874 aa  625  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 868 aa  629  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 855 aa  624  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 882 aa  621  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 871 aa  615  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 		 853 aa  612  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 850 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  39.53 
 
 		 859 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 		 887 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 		 853 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 854 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 903 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 854 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 865 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 872 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  38.02 
 
 		 853 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  39.51 
 
 		 828 aa  604  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 		 854 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 910 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 855 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 854 aa  602  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  37.4 
 
 		 874 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  38.41 
 
 		 868 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 		 852 aa  602  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 		 862 aa  601  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 910 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 881 aa  598  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.93 
 
 		 856 aa  598  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 		 882 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 		 892 aa  595  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  39.03 
 
 		 862 aa  597  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 888 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 901 aa  598  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 861 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 857 aa  597  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 853 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 853 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 		 855 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 		 855 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 888 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 856 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 		 855 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 853 aa  594  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  38.94 
 
 		 851 aa  595  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  38.56 
 
 		 884 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  38.56 
 
 		 884 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 853 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 853 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 882 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>