More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3422 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 867 aa  708    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 868 aa  686    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  49.33 
 
 		 871 aa  768    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  46.49 
 
 		 898 aa  660    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 		 903 aa  646    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 		 903 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 828 aa  637    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.13 
 
 		 868 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 		 872 aa  642    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 897 aa  694    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  45.9 
 
 		 891 aa  720    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 927 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  48.33 
 
 		 882 aa  688    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  43.13 
 
 		 869 aa  725    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  47.89 
 
 		 872 aa  768    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 856 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 872 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 		 850 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.23 
 
 		 872 aa  654    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  46.49 
 
 		 874 aa  664    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 		 870 aa  738    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 900 aa  649    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 872 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  47.78 
 
 		 882 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 854 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.75 
 
 		 882 aa  662    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  47.48 
 
 		 870 aa  753    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 860 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 873 aa  643    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  49.15 
 
 		 872 aa  778    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 		 904 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 859 aa  642    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  43.84 
 
 		 873 aa  729    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 878 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  44.24 
 
 		 881 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.38 
 
 		 863 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 871 aa  647    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  48.43 
 
 		 882 aa  698    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 853 aa  710    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 872 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 892 aa  655    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 854 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 875 aa  674    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  44.94 
 
 		 865 aa  642    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 874 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  48.24 
 
 		 869 aa  768    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 		 862 aa  650    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  44.4 
 
 		 887 aa  713    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.4 
 
 		 932 aa  699    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 854 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 863 aa  680    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 882 aa  690    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  48.3 
 
 		 872 aa  757    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 856 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  39.74 
 
 		 881 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 880 aa  1763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 		 910 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 		 910 aa  676    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  48.43 
 
 		 882 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.28 
 
 		 901 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 861 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 861 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 		 878 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 861 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42 
 
 		 859 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 		 837 aa  710    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 		 881 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 840 aa  653    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 		 857 aa  644    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 854 aa  649    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 		 896 aa  747    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.55 
 
 		 857 aa  669    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  45.75 
 
 		 889 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 		 868 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 861 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  45.63 
 
 		 870 aa  719    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 		 855 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 856 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 		 905 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 896 aa  633  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  36.57 
 
 		 848 aa  634  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.55 
 
 		 858 aa  634  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 863 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 		 855 aa  633  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 855 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.04 
 
 		 856 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 		 855 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 		 856 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 		 855 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 887 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 852 aa  632  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  39.77 
 
 		 855 aa  630  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 856 aa  631  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  44.21 
 
 		 823 aa  630  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 871 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 888 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 855 aa  632  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 859 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 888 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  39.22 
 
 		 895 aa  628  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>