More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1126 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 855 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 857 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  44.74 
 
 		 862 aa  688    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 		 858 aa  669    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  50.63 
 
 		 871 aa  825    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 857 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  43.46 
 
 		 856 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 881 aa  655    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  39.22 
 
 		 873 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  44.56 
 
 		 854 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.58 
 
 		 882 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 		 872 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  40.28 
 
 		 892 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 872 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 871 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 		 868 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  44.29 
 
 		 856 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 		 855 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 892 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 890 aa  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 894 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 863 aa  677    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  47.03 
 
 		 882 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 		 859 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 859 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 928 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 872 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 		 872 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 		 883 aa  658    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 		 900 aa  709    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 858 aa  638    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 		 895 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.59 
 
 		 854 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 		 858 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  44.76 
 
 		 863 aa  685    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 		 860 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  48.01 
 
 		 870 aa  782    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  48.24 
 
 		 870 aa  793    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 855 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 		 854 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 873 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 		 851 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  49.31 
 
 		 872 aa  799    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 904 aa  705    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 871 aa  641    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 892 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 		 874 aa  665    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.46 
 
 		 882 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 881 aa  1807    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 855 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  44.09 
 
 		 863 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 875 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  46.37 
 
 		 882 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 856 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  44.15 
 
 		 823 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 892 aa  669    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  45.99 
 
 		 870 aa  781    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  49.08 
 
 		 872 aa  818    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 871 aa  636    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  43.99 
 
 		 905 aa  684    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  45.22 
 
 		 887 aa  656    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 857 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 884 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 884 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  47.85 
 
 		 872 aa  789    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 859 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  43.85 
 
 		 862 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  44.33 
 
 		 887 aa  751    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 		 872 aa  666    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 859 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 855 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 853 aa  674    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  46.13 
 
 		 932 aa  742    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.57 
 
 		 882 aa  682    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 856 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 		 872 aa  670    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  43.35 
 
 		 856 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 889 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 853 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 856 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 910 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  40.46 
 
 		 910 aa  696    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 855 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 901 aa  643    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 		 861 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 		 861 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  45.11 
 
 		 878 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 861 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.05 
 
 		 859 aa  719    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 855 aa  667    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 		 869 aa  758    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 855 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 890 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 		 878 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 		 867 aa  736    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  44.39 
 
 		 854 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  42.39 
 
 		 863 aa  656    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 		 857 aa  663    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  48.52 
 
 		 889 aa  814    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 		 868 aa  702    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>