More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1900 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 858 aa  677    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 		 871 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 868 aa  636    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  53.54 
 
 		 891 aa  966    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 872 aa  719    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 		 858 aa  669    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  56.36 
 
 		 855 aa  1005    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 		 873 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  56.15 
 
 		 863 aa  1006    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  51.48 
 
 		 898 aa  867    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  45.17 
 
 		 869 aa  738    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 900 aa  684    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 894 aa  639    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  59.22 
 
 		 869 aa  1057    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  46.55 
 
 		 872 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.32 
 
 		 870 aa  724    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  45.93 
 
 		 873 aa  754    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.8 
 
 		 932 aa  681    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.98 
 
 		 872 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 869 aa  692    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  59.01 
 
 		 886 aa  1068    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 868 aa  1793    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  47.18 
 
 		 875 aa  791    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  45.89 
 
 		 878 aa  748    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  61.12 
 
 		 858 aa  1090    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 881 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  57.81 
 
 		 860 aa  1036    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  44.72 
 
 		 872 aa  730    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 837 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 891 aa  650    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 870 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 887 aa  699    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 828 aa  637    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 		 882 aa  688    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 853 aa  644    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.63 
 
 		 870 aa  721    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  57.76 
 
 		 856 aa  1052    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  44.8 
 
 		 896 aa  704    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 862 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.77 
 
 		 859 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 867 aa  670    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  46.33 
 
 		 872 aa  769    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 		 863 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  57.88 
 
 		 864 aa  1036    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  46.06 
 
 		 871 aa  764    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 857 aa  642    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 889 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  43.42 
 
 		 858 aa  694    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 853 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 858 aa  632  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 897 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 872 aa  629  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 850 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 855 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 855 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  40.88 
 
 		 851 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 		 823 aa  626  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 		 855 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 855 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 855 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 880 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 862 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 853 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 853 aa  619  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 853 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 859 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 860 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 853 aa  622  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.14 
 
 		 862 aa  620  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 		 868 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  40.14 
 
 		 855 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 910 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  40.46 
 
 		 854 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  40.3 
 
 		 853 aa  619  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 853 aa  619  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 853 aa  619  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 		 854 aa  618  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  40.14 
 
 		 860 aa  619  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 892 aa  618  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 		 884 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 		 884 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 853 aa  619  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  40.3 
 
 		 853 aa  619  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 		 910 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 861 aa  618  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 859 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 		 855 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 853 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 854 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 854 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 		 871 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 		 854 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 		 861 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 856 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 872 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 856 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.07 
 
 		 863 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 856 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 903 aa  609  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>