More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1424 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  42.37 
 
 
853 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
853 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 
854 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  45.64 
 
 
858 aa  720    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  82 
 
 
871 aa  1467    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 
857 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 
891 aa  696    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  75.34 
 
 
872 aa  1351    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  42.57 
 
 
873 aa  720    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  47.07 
 
 
854 aa  714    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 
874 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  45.01 
 
 
882 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  44.27 
 
 
892 aa  730    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 
872 aa  689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 
858 aa  656    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 
910 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  43.84 
 
 
856 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 
855 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  46.93 
 
 
892 aa  730    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 
890 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  46.93 
 
 
894 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 
891 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 
855 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 
872 aa  720    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 
859 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 
860 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 
891 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 
922 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.2 
 
 
858 aa  694    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  48.39 
 
 
900 aa  792    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  45.06 
 
 
850 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 
939 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 
854 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 
938 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 
863 aa  680    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 
860 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 
856 aa  668    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  61.14 
 
 
870 aa  1097    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  42.1 
 
 
883 aa  687    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 
872 aa  684    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  44.81 
 
 
873 aa  705    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 
853 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
872 aa  1771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
904 aa  707    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
871 aa  699    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  46.93 
 
 
892 aa  730    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 
905 aa  683    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 
882 aa  672    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 
902 aa  652    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 
939 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.79 
 
 
863 aa  750    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 
893 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  53.4 
 
 
882 aa  779    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 
939 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  49.37 
 
 
868 aa  826    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  46.63 
 
 
892 aa  736    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  66.25 
 
 
870 aa  1185    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  43.61 
 
 
856 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 
856 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 
857 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 
887 aa  710    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  45.68 
 
 
855 aa  735    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 
884 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 
884 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 
898 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  50.9 
 
 
870 aa  860    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
862 aa  675    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  47.03 
 
 
887 aa  783    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  45.97 
 
 
868 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 
859 aa  701    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 
881 aa  709    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  43.81 
 
 
916 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 
855 aa  645    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  47.13 
 
 
882 aa  758    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  42.99 
 
 
862 aa  688    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  44.72 
 
 
872 aa  723    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 
885 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 
861 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 
889 aa  656    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 
881 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  44.66 
 
 
856 aa  721    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  45.81 
 
 
910 aa  776    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  49.13 
 
 
910 aa  775    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 
872 aa  720    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
901 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  44.11 
 
 
861 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 
861 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 
878 aa  681    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  43.92 
 
 
861 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  49.49 
 
 
859 aa  793    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 
939 aa  663    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 
886 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 
855 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
840 aa  662    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  43.32 
 
 
857 aa  665    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 
854 aa  684    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 
852 aa  668    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
854 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  46.41 
 
 
857 aa  736    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 
889 aa  855    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>