More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1576 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 
882 aa  666    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  43.92 
 
 
869 aa  702    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 
871 aa  680    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
869 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  46.29 
 
 
873 aa  789    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 
872 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  48.15 
 
 
892 aa  791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  47.21 
 
 
858 aa  750    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.32 
 
 
870 aa  727    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 
868 aa  651    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  48.6 
 
 
892 aa  795    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  48.71 
 
 
890 aa  795    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  48.26 
 
 
894 aa  791    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  47.81 
 
 
892 aa  786    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 
867 aa  709    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 
896 aa  715    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 
932 aa  651    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.54 
 
 
900 aa  656    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
865 aa  661    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 
863 aa  678    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.82 
 
 
870 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  46.23 
 
 
872 aa  773    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  43.73 
 
 
868 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  49.28 
 
 
903 aa  850    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  48.32 
 
 
895 aa  823    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 
872 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  48.6 
 
 
892 aa  795    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.07 
 
 
863 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  46.23 
 
 
872 aa  773    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 
870 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 
872 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 
897 aa  663    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 
873 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 
887 aa  682    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  48.15 
 
 
892 aa  791    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  48.6 
 
 
892 aa  795    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
850 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.76 
 
 
910 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 
910 aa  662    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  50.75 
 
 
860 aa  845    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 
891 aa  649    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 
880 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  48.26 
 
 
890 aa  795    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  48.26 
 
 
890 aa  792    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  47.75 
 
 
840 aa  780    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  51.22 
 
 
857 aa  866    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
854 aa  1746    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  48.16 
 
 
852 aa  788    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  50.45 
 
 
881 aa  885    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
868 aa  633  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.98 
 
 
859 aa  626  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 
881 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 
858 aa  615  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.76 
 
 
858 aa  616  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 
837 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.84 
 
 
853 aa  612  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 
882 aa  612  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 
889 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 
848 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 
871 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 
874 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 
858 aa  598  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  37.99 
 
 
857 aa  595  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 
854 aa  594  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 
853 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 
862 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 
868 aa  594  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 
862 aa  589  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 
862 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  37.88 
 
 
875 aa  588  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  39.08 
 
 
856 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 
871 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  38.48 
 
 
855 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 
887 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.72 
 
 
859 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  38.26 
 
 
856 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 
856 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 
856 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  38.52 
 
 
853 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  38.43 
 
 
862 aa  579  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 
867 aa  581  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 
859 aa  579  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 
856 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 
854 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  38.36 
 
 
872 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 
902 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 
885 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  38.07 
 
 
861 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 
819 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  38.41 
 
 
861 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.49 
 
 
928 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 
855 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 
884 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 
884 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 
865 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 
888 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 
854 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 
882 aa  572  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  37.32 
 
 
892 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  37.88 
 
 
859 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>