More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1477 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 
823 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 
855 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 
855 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 
858 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  46.99 
 
 
871 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  44.15 
 
 
874 aa  683    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 
855 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
856 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
873 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 
854 aa  636    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 
890 aa  654    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.07 
 
 
858 aa  655    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 
892 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 
892 aa  655    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 
856 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  44.94 
 
 
873 aa  754    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
855 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  47.61 
 
 
869 aa  746    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 
892 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 
890 aa  661    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 
894 aa  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 
872 aa  679    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 
863 aa  732    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 
881 aa  663    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 
888 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  40.92 
 
 
890 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 
892 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  44.85 
 
 
903 aa  690    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 
928 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  48.17 
 
 
900 aa  806    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 
855 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 
878 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  43.93 
 
 
854 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  43.55 
 
 
869 aa  721    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  45.22 
 
 
837 aa  698    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
860 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  46.83 
 
 
870 aa  730    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  46.69 
 
 
870 aa  738    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 
855 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
819 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 
873 aa  654    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.56 
 
 
870 aa  760    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  46.41 
 
 
872 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 
904 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  42.1 
 
 
863 aa  671    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 
892 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.88 
 
 
868 aa  738    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 
882 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  43.11 
 
 
872 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 
856 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  47.82 
 
 
863 aa  744    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 
895 aa  679    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
854 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 
850 aa  682    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  44.67 
 
 
892 aa  730    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 
856 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
875 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.82 
 
 
872 aa  705    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 
892 aa  658    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 
855 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 
862 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
888 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  45.93 
 
 
932 aa  746    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 
872 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
856 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.62 
 
 
896 aa  752    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  47.46 
 
 
887 aa  818    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 
872 aa  679    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 
855 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  45.83 
 
 
864 aa  692    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
856 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 
793 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 
882 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 
853 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  43.24 
 
 
907 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  46.23 
 
 
872 aa  728    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  44.3 
 
 
793 aa  659    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  47.7 
 
 
882 aa  704    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 
872 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
871 aa  641    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  44.73 
 
 
910 aa  714    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  44.21 
 
 
910 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  45.14 
 
 
853 aa  753    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 
901 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 
864 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 
860 aa  685    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
878 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 
861 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.74 
 
 
859 aa  748    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 
881 aa  691    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 
855 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 
855 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 
868 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 
857 aa  654    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 
867 aa  761    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 
885 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 
855 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
857 aa  1735    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 
889 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 
868 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>