More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0095 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 858 aa  649    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 858 aa  659    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 871 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 		 869 aa  694    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 891 aa  1834    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 872 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  54.28 
 
 		 869 aa  1008    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  52.61 
 
 		 863 aa  962    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 867 aa  673    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  50.56 
 
 		 898 aa  833    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 		 871 aa  689    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 896 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 891 aa  652    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  55.58 
 
 		 855 aa  1016    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 900 aa  657    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  54.11 
 
 		 886 aa  956    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 870 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 		 873 aa  699    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 872 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 		 862 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 		 872 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  54.38 
 
 		 864 aa  983    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 870 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  43.06 
 
 		 878 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  44.73 
 
 		 875 aa  742    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  55.19 
 
 		 860 aa  1000    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 		 887 aa  662    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 		 837 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 882 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  53.66 
 
 		 868 aa  971    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 872 aa  681    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  53.81 
 
 		 858 aa  988    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  53.7 
 
 		 856 aa  966    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 		 932 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 		 872 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 		 869 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.77 
 
 		 858 aa  665    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 889 aa  673    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  39.74 
 
 		 870 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 872 aa  629  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 873 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 823 aa  627  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 868 aa  627  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.87 
 
 		 859 aa  624  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.26 
 
 		 853 aa  622  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 894 aa  615  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 859 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  40.52 
 
 		 828 aa  611  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 883 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 874 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 861 aa  612  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 		 863 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 		 868 aa  607  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 		 881 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.21 
 
 		 861 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 871 aa  606  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.21 
 
 		 857 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 		 856 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 		 856 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 859 aa  604  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.21 
 
 		 861 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  39.13 
 
 		 868 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 		 856 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 		 856 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.15 
 
 		 881 aa  602  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.07 
 
 		 928 aa  599  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 861 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 854 aa  598  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 		 897 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 860 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 856 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 		 887 aa  595  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 854 aa  594  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 854 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 856 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 		 855 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 910 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 878 aa  592  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 		 859 aa  592  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 854 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  38.36 
 
 		 855 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 858 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 		 896 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.57 
 
 		 863 aa  588  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  37.54 
 
 		 884 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  37.54 
 
 		 884 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  39 
 
 		 930 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 		 910 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  38.62 
 
 		 852 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  38.13 
 
 		 859 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  38.15 
 
 		 863 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 854 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  37.46 
 
 		 871 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 		 862 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 874 aa  581  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 855 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 855 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  37.96 
 
 		 851 aa  582  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 		 968 aa  581  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>