More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1171 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  44.3 
 
 		 869 aa  756    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 928 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 882 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.26 
 
 		 858 aa  687    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  45.38 
 
 		 871 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  46.53 
 
 		 892 aa  795    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  48.58 
 
 		 896 aa  833    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 		 880 aa  675    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  47.51 
 
 		 873 aa  785    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 		 854 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  39.15 
 
 		 905 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 856 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  46.21 
 
 		 892 aa  793    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.87 
 
 		 882 aa  729    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  46.4 
 
 		 865 aa  726    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.42 
 
 		 858 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  46.03 
 
 		 892 aa  791    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  46.53 
 
 		 892 aa  798    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  46.64 
 
 		 892 aa  801    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  46.64 
 
 		 890 aa  799    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  46.7 
 
 		 894 aa  802    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 882 aa  655    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 855 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.54 
 
 		 882 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  47.47 
 
 		 853 aa  741    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 837 aa  702    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 		 881 aa  737    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  46.22 
 
 		 872 aa  768    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 		 881 aa  699    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  46.4 
 
 		 900 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  45.93 
 
 		 868 aa  743    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  51.42 
 
 		 869 aa  807    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  42.74 
 
 		 854 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 871 aa  661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 863 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  43.03 
 
 		 885 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 		 903 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.13 
 
 		 870 aa  756    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.67 
 
 		 823 aa  676    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  52.55 
 
 		 873 aa  941    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  43.41 
 
 		 873 aa  647    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  46.2 
 
 		 890 aa  796    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  45.76 
 
 		 872 aa  778    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 904 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  50.65 
 
 		 867 aa  871    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  46.64 
 
 		 892 aa  801    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  46.92 
 
 		 895 aa  817    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 		 882 aa  694    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 910 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 856 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  49.5 
 
 		 863 aa  771    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 927 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  43.91 
 
 		 882 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  48.12 
 
 		 868 aa  839    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 		 892 aa  679    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 		 903 aa  768    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 864 aa  641    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  49.63 
 
 		 850 aa  763    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  49.95 
 
 		 932 aa  912    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 887 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 883 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  48.04 
 
 		 897 aa  856    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  46.34 
 
 		 872 aa  761    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.53 
 
 		 874 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  51.58 
 
 		 870 aa  941    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  49.23 
 
 		 863 aa  865    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  43.06 
 
 		 887 aa  742    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 874 aa  638    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 888 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 		 872 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 		 854 aa  666    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 848 aa  659    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 882 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 872 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  46.22 
 
 		 872 aa  768    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 888 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 		 854 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 907 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.07 
 
 		 872 aa  686    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 875 aa  654    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  98.13 
 
 		 910 aa  1809    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 910 aa  1835    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  44.99 
 
 		 898 aa  666    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.21 
 
 		 901 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 		 872 aa  645    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  39.08 
 
 		 867 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 		 878 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 861 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  49.63 
 
 		 859 aa  786    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  46.71 
 
 		 870 aa  742    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  46.36 
 
 		 890 aa  800    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 		 860 aa  792    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  42.93 
 
 		 840 aa  663    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 857 aa  681    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 854 aa  662    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 852 aa  660    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  45.47 
 
 		 872 aa  763    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.21 
 
 		 857 aa  709    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.84 
 
 		 889 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 868 aa  701    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>