More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1976 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 
871 aa  711    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 
882 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.18 
 
 
858 aa  641    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 
869 aa  708    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 
932 aa  709    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 
896 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  59.47 
 
 
927 aa  1069    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
860 aa  638    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 
872 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 
900 aa  655    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 
868 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 
870 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 
865 aa  637    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 
891 aa  654    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 
867 aa  691    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 
870 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
872 aa  707    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
904 aa  1863    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  69.09 
 
 
910 aa  1276    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 
863 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 
837 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 
872 aa  703    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  68.95 
 
 
905 aa  1243    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
881 aa  705    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 
887 aa  658    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 
870 aa  703    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 
869 aa  682    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 
863 aa  677    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 
880 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 
873 aa  690    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 
910 aa  658    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 
910 aa  656    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  60.4 
 
 
896 aa  1084    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.49 
 
 
859 aa  663    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  59.11 
 
 
872 aa  1059    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 
857 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
889 aa  694    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 
868 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 
858 aa  632  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 
872 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 
872 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 
872 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 
897 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
882 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 
882 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
898 aa  620  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  37.99 
 
 
881 aa  621  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  42.7 
 
 
882 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 
903 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 
858 aa  618  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 
873 aa  618  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
882 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.03 
 
 
892 aa  616  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 
854 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  36.11 
 
 
868 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.56 
 
 
853 aa  613  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 
863 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 
874 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  39.49 
 
 
928 aa  615  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 
862 aa  609  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 
859 aa  606  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  36.93 
 
 
895 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 
882 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.81 
 
 
878 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  37.23 
 
 
892 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  36.91 
 
 
890 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  38.17 
 
 
840 aa  599  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 
892 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  41.73 
 
 
885 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  35.71 
 
 
894 aa  597  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.07 
 
 
823 aa  597  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 
892 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 
850 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 
887 aa  598  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 
863 aa  598  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  37.19 
 
 
892 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 
861 aa  596  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 
886 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.5 
 
 
857 aa  597  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  35.63 
 
 
868 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 
864 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  37.04 
 
 
892 aa  595  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  37.31 
 
 
890 aa  595  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  36.93 
 
 
894 aa  594  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  39 
 
 
892 aa  594  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  37.13 
 
 
890 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 
903 aa  592  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 
877 aa  589  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 
938 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 
864 aa  592  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.87 
 
 
856 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 
885 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 
819 aa  591  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 
855 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  37.27 
 
 
852 aa  592  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.87 
 
 
856 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 
881 aa  586  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 
877 aa  588  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
856 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  36.96 
 
 
875 aa  588  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>