More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1064 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 
851 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 
853 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 
856 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.6 
 
 
858 aa  720    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  64.64 
 
 
871 aa  1142    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 
857 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 
891 aa  682    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  41.9 
 
 
895 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 
873 aa  716    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  45.06 
 
 
854 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 
874 aa  678    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
855 aa  676    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 
892 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 
872 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 
883 aa  652    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 
928 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 
856 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
855 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 
892 aa  692    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 
890 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 
894 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 
891 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  51.02 
 
 
882 aa  755    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 
859 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 
859 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.96 
 
 
854 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  45.82 
 
 
872 aa  702    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 
859 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 
939 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  45.2 
 
 
900 aa  729    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
856 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  48.67 
 
 
868 aa  815    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.81 
 
 
854 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 
938 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 
863 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 
860 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 
939 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  56.72 
 
 
870 aa  1013    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 
903 aa  642    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 
910 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  45.33 
 
 
873 aa  701    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 
905 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  66.25 
 
 
872 aa  1185    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 
904 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 
871 aa  675    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 
892 aa  692    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
854 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.21 
 
 
882 aa  645    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  48.01 
 
 
881 aa  782    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 
855 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.56 
 
 
863 aa  746    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 
893 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 
882 aa  732    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  41.88 
 
 
862 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 
892 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  49.03 
 
 
870 aa  829    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 
891 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 
856 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  65.56 
 
 
872 aa  1164    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 
887 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 
855 aa  696    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
884 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
884 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
856 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 
858 aa  701    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 
862 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  44.73 
 
 
887 aa  733    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
856 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 
859 aa  667    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 
939 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 
857 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 
851 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  44.67 
 
 
882 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 
939 aa  670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  45.53 
 
 
872 aa  732    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
885 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
870 aa  1773    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
872 aa  717    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 
881 aa  699    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 
856 aa  728    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  46.83 
 
 
910 aa  746    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  46.71 
 
 
910 aa  742    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 
856 aa  653    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 
901 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 
861 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 
861 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 
878 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 
861 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  47.39 
 
 
859 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 
853 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  42.39 
 
 
886 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
855 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 
840 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 
857 aa  638    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 
854 aa  643    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
872 aa  717    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
871 aa  686    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  46.83 
 
 
857 aa  730    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  48.97 
 
 
889 aa  808    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.44 
 
 
868 aa  717    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>