More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0730 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  46.84 
 
 		 872 aa  788    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 853 aa  696    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  44.11 
 
 		 854 aa  643    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 858 aa  709    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  52.11 
 
 		 871 aa  881    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 		 857 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 891 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 855 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 873 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 		 854 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 		 858 aa  705    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 		 874 aa  686    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  43.28 
 
 		 907 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 		 856 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  47.02 
 
 		 932 aa  782    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 		 872 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 		 857 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 855 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 		 896 aa  738    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 860 aa  688    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  44.05 
 
 		 855 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 868 aa  740    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  45.01 
 
 		 872 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  44.8 
 
 		 871 aa  687    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 		 859 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 		 862 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 		 857 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 		 867 aa  743    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  43.7 
 
 		 863 aa  704    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 		 900 aa  742    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 		 855 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 		 895 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  45.29 
 
 		 854 aa  668    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  44.23 
 
 		 873 aa  759    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 		 863 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 		 860 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 		 872 aa  650    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  50.86 
 
 		 870 aa  880    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 		 905 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 880 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  44.9 
 
 		 873 aa  702    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 888 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 		 872 aa  855    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 904 aa  694    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 878 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 864 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 903 aa  649    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  45.31 
 
 		 882 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  50.85 
 
 		 882 aa  746    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 		 870 aa  758    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  47.69 
 
 		 863 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 858 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  52.44 
 
 		 882 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 855 aa  680    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 		 861 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 892 aa  660    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  48.71 
 
 		 882 aa  715    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 854 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 881 aa  662    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.1 
 
 		 868 aa  695    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 887 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 		 872 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.28 
 
 		 882 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  45.59 
 
 		 863 aa  775    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  46.06 
 
 		 837 aa  763    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  50.74 
 
 		 882 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 		 862 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 887 aa  723    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 		 855 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 859 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 853 aa  646    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  49.14 
 
 		 872 aa  850    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 890 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  45.5 
 
 		 882 aa  695    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  48.52 
 
 		 881 aa  814    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 		 928 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  45.09 
 
 		 872 aa  716    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 868 aa  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  48.97 
 
 		 870 aa  808    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  43.93 
 
 		 910 aa  695    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  44.41 
 
 		 885 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 856 aa  649    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 		 910 aa  706    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  44.84 
 
 		 910 aa  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  49.25 
 
 		 823 aa  728    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 901 aa  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 861 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  48.57 
 
 		 869 aa  818    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  47.07 
 
 		 850 aa  711    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 861 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.84 
 
 		 859 aa  736    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 		 856 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 883 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 855 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  43.38 
 
 		 927 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 855 aa  650    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  45.01 
 
 		 875 aa  708    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.72 
 
 		 869 aa  757    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 		 874 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 		 857 aa  707    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>