More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2495 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  42.33 
 
 		 853 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 853 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 		 881 aa  689    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.97 
 
 		 858 aa  697    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  70.72 
 
 		 871 aa  1261    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 		 857 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  43.08 
 
 		 891 aa  690    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 		 857 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 873 aa  712    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  45.99 
 
 		 854 aa  703    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 		 853 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.41 
 
 		 854 aa  671    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 892 aa  683    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 872 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 883 aa  664    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 		 871 aa  675    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 		 856 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 855 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  42.04 
 
 		 892 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 890 aa  686    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 894 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 891 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 858 aa  678    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  42.07 
 
 		 862 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  43.32 
 
 		 859 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  42.57 
 
 		 860 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 939 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 		 855 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  44.26 
 
 		 905 aa  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 		 900 aa  736    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 895 aa  697    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 874 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 		 854 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 938 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 863 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 860 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  50.4 
 
 		 882 aa  755    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  60.5 
 
 		 870 aa  1061    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  41.73 
 
 		 851 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 939 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  44.31 
 
 		 873 aa  702    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 		 859 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  70.79 
 
 		 872 aa  1267    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 		 904 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 		 871 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  42.04 
 
 		 892 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 		 856 aa  668    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.57 
 
 		 882 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 860 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  49.6 
 
 		 870 aa  827    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  47.12 
 
 		 863 aa  729    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 893 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 		 882 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 		 855 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 		 892 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 		 855 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.62 
 
 		 872 aa  686    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 939 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 854 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 887 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  75.11 
 
 		 872 aa  1335    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 884 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 884 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 939 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 		 872 aa  710    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 		 862 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  44.81 
 
 		 887 aa  734    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 856 aa  684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 859 aa  694    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  48.51 
 
 		 868 aa  819    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 		 853 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 		 856 aa  688    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  46.61 
 
 		 882 aa  745    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 891 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 885 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  44.51 
 
 		 872 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 889 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 		 872 aa  710    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 		 856 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  44.36 
 
 		 910 aa  759    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  44.3 
 
 		 910 aa  756    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 		 856 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 901 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 		 861 aa  692    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 861 aa  690    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.09 
 
 		 878 aa  675    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 		 861 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  46.47 
 
 		 859 aa  769    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 856 aa  690    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 886 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  43.63 
 
 		 855 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  42.99 
 
 		 840 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 857 aa  679    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 854 aa  665    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 852 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 853 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  47.61 
 
 		 857 aa  746    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  48.57 
 
 		 889 aa  818    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.42 
 
 		 868 aa  721    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 861 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>