More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0346 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  48.32 
 
 
850 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  43.91 
 
 
859 aa  660    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  48.94 
 
 
871 aa  740    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
823 aa  1689    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 
873 aa  647    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  45.6 
 
 
854 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  47.09 
 
 
870 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  44.47 
 
 
891 aa  663    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  48.82 
 
 
869 aa  750    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 
863 aa  637    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  45.97 
 
 
869 aa  701    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  44.07 
 
 
855 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  47.58 
 
 
873 aa  733    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  45.06 
 
 
855 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  44.86 
 
 
863 aa  661    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  46.2 
 
 
837 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 
867 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.71 
 
 
897 aa  701    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  44.07 
 
 
859 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  46.38 
 
 
862 aa  667    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 
869 aa  640    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 
900 aa  652    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  46.66 
 
 
865 aa  662    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 
872 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.85 
 
 
854 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 
885 aa  670    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 
860 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  48.84 
 
 
870 aa  752    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  49.15 
 
 
872 aa  761    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.91 
 
 
871 aa  637    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.47 
 
 
863 aa  672    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  48.2 
 
 
882 aa  646    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  44.31 
 
 
858 aa  650    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  43.91 
 
 
871 aa  659    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  47.7 
 
 
882 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  46.34 
 
 
870 aa  738    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 
872 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 
887 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  44.34 
 
 
854 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  47.57 
 
 
882 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 
868 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  47.16 
 
 
872 aa  723    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 
887 aa  655    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  48.63 
 
 
872 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 
882 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  46.13 
 
 
932 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
874 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  46.08 
 
 
898 aa  650    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
856 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  47.52 
 
 
896 aa  735    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.95 
 
 
910 aa  677    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 
910 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.77 
 
 
901 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 
860 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  43.24 
 
 
888 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44.32 
 
 
859 aa  655    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  48.14 
 
 
855 aa  716    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.31 
 
 
882 aa  665    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  45.12 
 
 
875 aa  665    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  44.15 
 
 
881 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 
855 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 
857 aa  639    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  49.25 
 
 
889 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.52 
 
 
868 aa  645    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 
903 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 
858 aa  634  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
888 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 
858 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  44.43 
 
 
855 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
928 aa  633  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 
858 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  44.4 
 
 
878 aa  635  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  45.34 
 
 
878 aa  632  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  44.43 
 
 
855 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.34 
 
 
863 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 
883 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  44.88 
 
 
880 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 
854 aa  631  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
882 aa  631  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 
872 aa  631  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  44.21 
 
 
880 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  44.75 
 
 
857 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 
856 aa  631  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  44.79 
 
 
896 aa  632  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  44.75 
 
 
857 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  43.29 
 
 
854 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  43.13 
 
 
852 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
851 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 
895 aa  625  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  44.88 
 
 
857 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 
868 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 
891 aa  622  1e-177  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  47.45 
 
 
882 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
853 aa  624  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 
886 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
855 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  44.74 
 
 
859 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
855 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 
855 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
855 aa  622  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>