More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0767 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 
858 aa  697    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.56 
 
 
871 aa  721    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  61.01 
 
 
886 aa  1092    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  52.38 
 
 
891 aa  953    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 
896 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
894 aa  650    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
863 aa  1767    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
872 aa  709    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 
823 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 
875 aa  791    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
867 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  56.15 
 
 
868 aa  1006    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 
881 aa  677    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  57.11 
 
 
869 aa  1023    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  43.97 
 
 
828 aa  661    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  39.81 
 
 
928 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 
900 aa  685    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 
863 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 
872 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.76 
 
 
870 aa  727    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  54.97 
 
 
855 aa  993    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  44.7 
 
 
873 aa  729    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 
858 aa  687    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  45.06 
 
 
872 aa  740    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  46.26 
 
 
872 aa  750    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 
865 aa  636    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
869 aa  703    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  42.72 
 
 
858 aa  708    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 
871 aa  734    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  46.24 
 
 
872 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 
882 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  61.86 
 
 
864 aa  1100    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.97 
 
 
869 aa  721    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 
853 aa  687    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 
863 aa  647    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
887 aa  709    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.4 
 
 
873 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 
837 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
882 aa  702    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 
932 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.65 
 
 
870 aa  743    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  58.04 
 
 
858 aa  1043    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  55.83 
 
 
860 aa  997    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 
870 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  62.73 
 
 
856 aa  1136    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  51.84 
 
 
898 aa  874    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  45.44 
 
 
878 aa  760    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 
874 aa  650    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.91 
 
 
859 aa  662    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 
896 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 
872 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 
862 aa  691    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.52 
 
 
891 aa  702    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 
868 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.1 
 
 
857 aa  671    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  43.7 
 
 
889 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.99 
 
 
868 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 
872 aa  635  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 
850 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 
883 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 
910 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 
910 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  39.35 
 
 
854 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 
852 aa  626  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 
853 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 
855 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 
871 aa  622  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 
855 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 
882 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 
860 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 
859 aa  623  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 
868 aa  624  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 
855 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.54 
 
 
871 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 
874 aa  621  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 
854 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.9 
 
 
855 aa  620  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
863 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 
882 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 
855 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 
855 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 
859 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  40.05 
 
 
853 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
853 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 
854 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
853 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
853 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  40.14 
 
 
860 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  40.05 
 
 
853 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 
851 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
853 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 
887 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 
862 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
853 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 
878 aa  616  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 
854 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 
853 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  39.21 
 
 
853 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 
859 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.77 
 
 
855 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>