More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1449 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  45.48 
 
 		 853 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  45.48 
 
 		 853 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  45.44 
 
 		 870 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 		 858 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  48.3 
 
 		 871 aa  763    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  45.72 
 
 		 857 aa  729    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  46.34 
 
 		 855 aa  746    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  44.81 
 
 		 874 aa  753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 		 898 aa  660    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  46.37 
 
 		 854 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  46 
 
 		 853 aa  722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  45.03 
 
 		 882 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 		 928 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  45.21 
 
 		 872 aa  713    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  45.68 
 
 		 859 aa  733    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 		 910 aa  662    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  47.17 
 
 		 856 aa  736    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  44.83 
 
 		 855 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 939 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  46.06 
 
 		 855 aa  731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  45.48 
 
 		 853 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 891 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 846 aa  651    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 		 846 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  45.12 
 
 		 859 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  44.43 
 
 		 860 aa  690    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  45.28 
 
 		 856 aa  740    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  46.05 
 
 		 922 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  42.19 
 
 		 870 aa  692    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 900 aa  643    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  46.06 
 
 		 851 aa  740    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  45.69 
 
 		 857 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 		 872 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 		 938 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  47.57 
 
 		 863 aa  743    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  46.33 
 
 		 860 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  45.48 
 
 		 860 aa  697    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  45.52 
 
 		 870 aa  724    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  46.17 
 
 		 851 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  45.29 
 
 		 870 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  43.8 
 
 		 873 aa  680    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  47.45 
 
 		 854 aa  748    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  47.33 
 
 		 872 aa  748    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 904 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 871 aa  703    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  46.82 
 
 		 856 aa  747    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 		 872 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 895 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 902 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  45.1 
 
 		 863 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 893 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  47.5 
 
 		 882 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 		 910 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  47.46 
 
 		 856 aa  758    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  47.81 
 
 		 856 aa  766    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  46.8 
 
 		 868 aa  697    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  46.1 
 
 		 877 aa  656    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 		 939 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  44.54 
 
 		 887 aa  731    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  46.92 
 
 		 882 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 		 884 aa  696    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 		 884 aa  696    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 864 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  44.83 
 
 		 908 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  46.29 
 
 		 862 aa  740    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.74 
 
 		 887 aa  685    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 		 858 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  47.11 
 
 		 859 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 907 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  44.43 
 
 		 916 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  43.98 
 
 		 855 aa  689    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 882 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  45.14 
 
 		 879 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  45.37 
 
 		 862 aa  720    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  44.43 
 
 		 885 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 		 883 aa  714    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  44.93 
 
 		 889 aa  715    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  44.42 
 
 		 881 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 		 881 aa  702    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  47.23 
 
 		 859 aa  756    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  45.59 
 
 		 877 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  45.38 
 
 		 856 aa  716    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 868 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  47.24 
 
 		 861 aa  752    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  47.24 
 
 		 861 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  48.39 
 
 		 878 aa  742    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 		 861 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.74 
 
 		 859 aa  678    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  45.58 
 
 		 853 aa  737    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 886 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  46.34 
 
 		 855 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  45.19 
 
 		 871 aa  724    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 939 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 939 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 855 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  47.69 
 
 		 856 aa  762    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 857 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  45.1 
 
 		 889 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 868 aa  1780    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  47.24 
 
 		 861 aa  753    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>