More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2957 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  83.98 
 
 
853 aa  1445    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  83.98 
 
 
853 aa  1445    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  66.04 
 
 
859 aa  1160    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 
871 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  58.29 
 
 
857 aa  996    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  85.63 
 
 
851 aa  1520    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  65.38 
 
 
855 aa  1137    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  67.52 
 
 
856 aa  1168    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  59.76 
 
 
854 aa  1016    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  67.17 
 
 
854 aa  1154    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  52.88 
 
 
882 aa  821    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 
872 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  61.87 
 
 
872 aa  1077    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  47.69 
 
 
890 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
881 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  67.13 
 
 
856 aa  1155    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  57.85 
 
 
855 aa  979    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  83.98 
 
 
853 aa  1445    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  52.89 
 
 
939 aa  850    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  52.89 
 
 
891 aa  850    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  52.48 
 
 
846 aa  872    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  52.59 
 
 
846 aa  869    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  57.61 
 
 
859 aa  987    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  58 
 
 
871 aa  994    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  52.96 
 
 
860 aa  836    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  50.17 
 
 
870 aa  756    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  53.85 
 
 
922 aa  856    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  52.89 
 
 
939 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 
900 aa  648    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  54.25 
 
 
850 aa  840    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  58.74 
 
 
874 aa  1045    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  65.69 
 
 
859 aa  1150    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  52.95 
 
 
938 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  61.43 
 
 
863 aa  1045    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  57.56 
 
 
860 aa  996    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  52.89 
 
 
939 aa  850    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 
870 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  53.14 
 
 
885 aa  833    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 
870 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  84.22 
 
 
853 aa  1450    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  84.56 
 
 
860 aa  1466    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 
872 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  67.52 
 
 
856 aa  1167    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  54.17 
 
 
871 aa  926    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  71.05 
 
 
862 aa  1246    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  67.25 
 
 
861 aa  1175    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 
928 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 
902 aa  835    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  58.36 
 
 
857 aa  997    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 
867 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  52.76 
 
 
893 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  85.39 
 
 
851 aa  1516    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  52.89 
 
 
939 aa  850    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  57.71 
 
 
880 aa  992    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  66.32 
 
 
856 aa  1162    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  52.09 
 
 
870 aa  785    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  72.2 
 
 
853 aa  1252    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  47 
 
 
882 aa  730    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  56.98 
 
 
887 aa  993    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  52.47 
 
 
884 aa  819    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  56.29 
 
 
884 aa  940    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  56.29 
 
 
884 aa  940    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  49.88 
 
 
864 aa  779    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1617  DNA mismatch repair protein MutS  52.87 
 
 
878 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  64.69 
 
 
862 aa  1122    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.52 
 
 
887 aa  645    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  65.21 
 
 
856 aa  1153    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  58.25 
 
 
859 aa  972    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  48.28 
 
 
871 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  55.25 
 
 
883 aa  976    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  53.33 
 
 
916 aa  848    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  69.47 
 
 
855 aa  1226    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.39 
 
 
882 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  57.88 
 
 
859 aa  994    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  58.5 
 
 
868 aa  926    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  53.14 
 
 
885 aa  852    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 
872 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  64.19 
 
 
889 aa  1119    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  67.52 
 
 
856 aa  1168    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  58.87 
 
 
855 aa  998    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  48.17 
 
 
911 aa  765    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 
932 aa  674    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  67.79 
 
 
856 aa  1197    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  85.75 
 
 
851 aa  1523    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  67.25 
 
 
861 aa  1175    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  67.13 
 
 
861 aa  1174    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  60.7 
 
 
878 aa  1000    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  66.31 
 
 
861 aa  1155    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  43.97 
 
 
859 aa  695    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  83.98 
 
 
853 aa  1445    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  52.81 
 
 
886 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  58.87 
 
 
855 aa  998    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 
870 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  85.25 
 
 
851 aa  1518    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  83.45 
 
 
853 aa  1462    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  52.76 
 
 
891 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  53.14 
 
 
885 aa  833    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 
857 aa  636    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
889 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  46.4 
 
 
868 aa  746    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>