More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4057 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  42.11 
 
 		 853 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 853 aa  651    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 858 aa  671    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  45.99 
 
 		 871 aa  756    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 857 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 891 aa  647    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 		 856 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 873 aa  669    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  45.45 
 
 		 854 aa  703    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 		 881 aa  729    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  41.87 
 
 		 903 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 853 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 872 aa  681    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 855 aa  667    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 853 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  44.39 
 
 		 856 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  42.74 
 
 		 855 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 860 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  42.95 
 
 		 880 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.88 
 
 		 882 aa  688    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 		 859 aa  722    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  44.69 
 
 		 846 aa  674    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  44.69 
 
 		 846 aa  672    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 859 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 		 860 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 		 856 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 895 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.24 
 
 		 881 aa  666    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 900 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  45.9 
 
 		 882 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  46.48 
 
 		 932 aa  778    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  45.22 
 
 		 854 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  45.13 
 
 		 859 aa  711    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.7 
 
 		 863 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 		 860 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.57 
 
 		 874 aa  699    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 		 870 aa  750    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 853 aa  661    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 856 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 873 aa  682    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 		 854 aa  702    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  45.57 
 
 		 872 aa  739    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 904 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 871 aa  680    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 		 856 aa  713    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  45.37 
 
 		 868 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  46.2 
 
 		 882 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 902 aa  648    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 883 aa  661    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  47.35 
 
 		 863 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 		 871 aa  678    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  46.77 
 
 		 882 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 859 aa  677    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 		 872 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 854 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  44.86 
 
 		 855 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.47 
 
 		 870 aa  779    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 905 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  44.8 
 
 		 887 aa  683    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 855 aa  681    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 		 884 aa  680    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 		 884 aa  680    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 		 857 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 		 851 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  46.59 
 
 		 862 aa  724    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  43.54 
 
 		 887 aa  741    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 		 862 aa  672    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 859 aa  693    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.54 
 
 		 872 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 867 aa  750    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 855 aa  648    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 		 882 aa  718    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 		 856 aa  703    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.03 
 
 		 858 aa  655    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 851 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 		 868 aa  752    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 		 889 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  45.8 
 
 		 872 aa  726    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  41.88 
 
 		 856 aa  660    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 910 aa  715    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 910 aa  717    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 		 856 aa  672    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  44.35 
 
 		 901 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  44.52 
 
 		 861 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  44.41 
 
 		 861 aa  713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  45.2 
 
 		 878 aa  701    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  46.39 
 
 		 861 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44.37 
 
 		 859 aa  726    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 872 aa  672    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 851 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 855 aa  680    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 840 aa  663    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 		 857 aa  673    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 854 aa  649    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 852 aa  653    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  38.54 
 
 		 872 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 		 857 aa  697    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 		 889 aa  724    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  47.79 
 
 		 868 aa  754    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  44.75 
 
 		 861 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>