More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0948 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  37.03 
 
 
890 aa  650    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 
871 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  39.49 
 
 
873 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 
892 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 
868 aa  672    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  39.03 
 
 
892 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 
890 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  38.93 
 
 
894 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 
865 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 
895 aa  669    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  37.14 
 
 
892 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 
872 aa  674    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.15 
 
 
900 aa  641    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  45.06 
 
 
863 aa  744    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 
903 aa  671    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  36.21 
 
 
891 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  38.66 
 
 
870 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.52 
 
 
896 aa  705    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  37.89 
 
 
890 aa  654    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 
897 aa  711    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 
872 aa  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 
853 aa  649    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  39.03 
 
 
892 aa  653    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
873 aa  743    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 
863 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 
868 aa  701    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
868 aa  1729    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  39.03 
 
 
892 aa  653    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  39.09 
 
 
869 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 
872 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 
869 aa  688    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 
887 aa  657    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.56 
 
 
870 aa  773    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  45.28 
 
 
867 aa  757    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 
881 aa  682    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 
872 aa  674    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 
892 aa  651    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 
870 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 
850 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 
872 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 
910 aa  745    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  45.93 
 
 
910 aa  742    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 
860 aa  681    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  37.82 
 
 
882 aa  657    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.95 
 
 
859 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  38.4 
 
 
840 aa  642    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 
932 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
854 aa  633  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.32 
 
 
857 aa  631  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 
848 aa  619  1e-176  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  36.58 
 
 
857 aa  615  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  35.68 
 
 
910 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  36.11 
 
 
904 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  36.09 
 
 
858 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  36.05 
 
 
852 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  36.1 
 
 
905 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 
894 aa  612  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  36.01 
 
 
896 aa  610  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  35.6 
 
 
889 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 
828 aa  607  9.999999999999999e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  37.53 
 
 
854 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  37.56 
 
 
882 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  36.3 
 
 
882 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  36.31 
 
 
858 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.38 
 
 
862 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  37.03 
 
 
837 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  36.85 
 
 
872 aa  602  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  36.58 
 
 
881 aa  599  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 
888 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  35.98 
 
 
880 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  38.31 
 
 
888 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  37.85 
 
 
886 aa  602  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  38.91 
 
 
885 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 
878 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  36.59 
 
 
892 aa  596  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  37.4 
 
 
872 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  38.26 
 
 
898 aa  598  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  35.73 
 
 
856 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  35.61 
 
 
856 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  35.5 
 
 
856 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  36.85 
 
 
858 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  37.7 
 
 
871 aa  594  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  36.51 
 
 
863 aa  595  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  35.5 
 
 
856 aa  592  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 
872 aa  591  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  37.21 
 
 
875 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  36.33 
 
 
859 aa  588  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  35.81 
 
 
856 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 
856 aa  588  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  36.35 
 
 
901 aa  585  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  35.44 
 
 
861 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  35.33 
 
 
861 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  38.28 
 
 
864 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  34.78 
 
 
863 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  37.82 
 
 
873 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 
868 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  36.76 
 
 
858 aa  582  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  36.21 
 
 
858 aa  579  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  37.05 
 
 
854 aa  580  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  37.23 
 
 
903 aa  582  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>