More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0008 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 
868 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  60.21 
 
 
868 aa  1021    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 
858 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 
871 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.65 
 
 
858 aa  665    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 
897 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.61 
 
 
869 aa  673    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 
873 aa  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 
860 aa  662    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 
872 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 
900 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 
896 aa  691    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  46.05 
 
 
932 aa  702    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 
870 aa  692    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
872 aa  681    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 
872 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 
872 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
873 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 
863 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
828 aa  643    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 
872 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 
903 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 
867 aa  693    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 
887 aa  665    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  36.76 
 
 
891 aa  640    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 
882 aa  668    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 
870 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 
870 aa  715    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.73 
 
 
910 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 
910 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  44.95 
 
 
863 aa  699    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
848 aa  1698    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.04 
 
 
859 aa  670    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 
857 aa  652    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 
869 aa  686    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 
857 aa  676    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 
895 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  36.57 
 
 
880 aa  634  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 
881 aa  633  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  38.5 
 
 
875 aa  633  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 
889 aa  634  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 
892 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 
860 aa  630  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 
882 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 
892 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 
894 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  37.13 
 
 
896 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 
892 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 
850 aa  632  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 
868 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 
892 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 
892 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 
890 aa  628  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 
892 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 
890 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 
890 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 
858 aa  628  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 
853 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  36.93 
 
 
881 aa  620  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 
868 aa  619  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  37.54 
 
 
865 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 
837 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  38.75 
 
 
878 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 
840 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 
873 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
872 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 
872 aa  611  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 
852 aa  610  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 
886 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  37.3 
 
 
863 aa  606  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 
854 aa  605  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 
868 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 
894 aa  602  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 
855 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 
862 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 
869 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  37.13 
 
 
863 aa  597  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 
860 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  36.07 
 
 
872 aa  589  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  37.02 
 
 
882 aa  589  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  36.85 
 
 
874 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  36.94 
 
 
871 aa  589  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  38.53 
 
 
856 aa  589  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  37.51 
 
 
858 aa  587  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  35.19 
 
 
882 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  35.08 
 
 
882 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  34.95 
 
 
859 aa  588  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 
898 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  36.12 
 
 
862 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  34.5 
 
 
882 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  36.64 
 
 
854 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  34.42 
 
 
904 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  36.61 
 
 
892 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  36.53 
 
 
862 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  36.83 
 
 
856 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  33.52 
 
 
910 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  38.9 
 
 
823 aa  585  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  35.73 
 
 
872 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 
793 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  35.42 
 
 
886 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>