More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3540 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  44.43 
 
 
863 aa  775    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 
858 aa  659    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 
871 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.28 
 
 
869 aa  731    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  49.28 
 
 
873 aa  875    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 
881 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  97.2 
 
 
892 aa  1734    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 
865 aa  708    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  47.12 
 
 
858 aa  781    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  96.97 
 
 
892 aa  1751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  97.08 
 
 
890 aa  1751    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  96.76 
 
 
894 aa  1752    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  96.86 
 
 
892 aa  1749    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  45.25 
 
 
896 aa  754    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.26 
 
 
858 aa  667    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
890 aa  1821    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 
900 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  90.61 
 
 
895 aa  1670    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  37.11 
 
 
868 aa  659    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
891 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 
870 aa  741    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  49.33 
 
 
872 aa  881    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 
872 aa  738    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  97.64 
 
 
890 aa  1763    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  96.97 
 
 
892 aa  1751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  44.12 
 
 
882 aa  708    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 
863 aa  719    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  46.94 
 
 
897 aa  792    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  49.33 
 
 
872 aa  881    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.08 
 
 
870 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  61.74 
 
 
903 aa  1145    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 
867 aa  767    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  40.47 
 
 
858 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  97.2 
 
 
892 aa  1731    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
872 aa  686    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 
872 aa  718    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  45.1 
 
 
853 aa  684    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
887 aa  721    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 
872 aa  645    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
869 aa  695    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  52.71 
 
 
881 aa  936    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  65.32 
 
 
860 aa  1208    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 
932 aa  766    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  46.23 
 
 
868 aa  808    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.52 
 
 
870 aa  782    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 
837 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  45.66 
 
 
910 aa  798    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  46.09 
 
 
910 aa  798    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  97.65 
 
 
892 aa  1727    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  45.64 
 
 
873 aa  778    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.46 
 
 
859 aa  717    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  44.72 
 
 
850 aa  706    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 
868 aa  693    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  48.59 
 
 
840 aa  801    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  49.55 
 
 
857 aa  872    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  48.26 
 
 
854 aa  808    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  47.53 
 
 
852 aa  793    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 
857 aa  665    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 
889 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 
874 aa  630  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.24 
 
 
862 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 
882 aa  632  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 
887 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 
901 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 
880 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 
854 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 
882 aa  627  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 
848 aa  628  1e-178  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
823 aa  622  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 
888 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 
888 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 
885 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 
874 aa  622  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 
868 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 
928 aa  614  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 
896 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  37.35 
 
 
905 aa  611  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
862 aa  611  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
853 aa  611  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 
898 aa  609  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 
878 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 
854 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 
856 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 
856 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  38.09 
 
 
873 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 
856 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  36.91 
 
 
904 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  37.69 
 
 
875 aa  607  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 
861 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  37.4 
 
 
863 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 
903 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 
854 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.74 
 
 
856 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 
872 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  38.02 
 
 
859 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 
854 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 
856 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 
859 aa  601  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 
867 aa  601  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 
861 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>