More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1250 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 823 aa  1675    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  57.33 
 
 		 793 aa  886    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  51.19 
 
 		 817 aa  751    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  56.94 
 
 		 793 aa  860    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  64.82 
 
 		 819 aa  1046    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 932 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  45.67 
 
 		 896 aa  626  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  44.4 
 
 		 828 aa  624  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  45.09 
 
 		 867 aa  623  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 872 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 853 aa  621  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 878 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 872 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 869 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 		 875 aa  611  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 870 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 868 aa  607  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 882 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 910 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 857 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  43.62 
 
 		 898 aa  600  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 910 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 		 872 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  41.9 
 
 		 903 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 		 873 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 		 871 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 863 aa  595  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 		 887 aa  594  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.98 
 
 		 850 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  42.29 
 
 		 858 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 		 871 aa  589  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 860 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 872 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 863 aa  588  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 894 aa  585  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 873 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 872 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.17 
 
 		 869 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 900 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 869 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 858 aa  580  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 870 aa  582  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 		 870 aa  579  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.03 
 
 		 859 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.8 
 
 		 858 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 		 868 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 891 aa  576  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 861 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 873 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 860 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 881 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 872 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 872 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 895 aa  571  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 		 856 aa  570  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 897 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 864 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 		 856 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 		 858 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 848 aa  567  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 		 856 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 		 856 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 		 867 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 854 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 		 856 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 		 851 aa  565  1.0000000000000001e-159  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 		 888 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 928 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 		 888 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 		 856 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 		 880 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 856 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 		 891 aa  560  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 865 aa  562  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 868 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 		 863 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 861 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 886 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 855 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 861 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 		 868 aa  562  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.31 
 
 		 862 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 859 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 		 863 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 		 882 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  38.69 
 
 		 855 aa  557  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.36 
 
 		 856 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 861 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  40.03 
 
 		 890 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 		 856 aa  555  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 858 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  38.92 
 
 		 823 aa  553  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  38.19 
 
 		 862 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 		 855 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 862 aa  554  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  37.89 
 
 		 889 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  40.03 
 
 		 892 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 		 887 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  40.03 
 
 		 890 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>