More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1001 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  50.61 
 
 		 817 aa  777    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 932 aa  639    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  46.11 
 
 		 896 aa  656    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  45.52 
 
 		 873 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 		 863 aa  638    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  44.54 
 
 		 853 aa  645    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 		 872 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 		 870 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 819 aa  1652    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  44.74 
 
 		 828 aa  642    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  65.07 
 
 		 823 aa  1051    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  57.86 
 
 		 793 aa  887    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  57.22 
 
 		 793 aa  901    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 		 857 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 		 867 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 875 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 		 872 aa  627  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 		 910 aa  625  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 887 aa  620  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.93 
 
 		 910 aa  621  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 869 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 863 aa  611  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 869 aa  606  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 871 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 		 873 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 		 878 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.54 
 
 		 872 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 		 864 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 860 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 873 aa  602  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 		 903 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  44.76 
 
 		 898 aa  598  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 880 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 		 850 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  40.17 
 
 		 896 aa  598  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 871 aa  594  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 895 aa  595  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 		 900 aa  592  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 870 aa  595  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 		 861 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 		 861 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.99 
 
 		 859 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 		 889 aa  594  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 868 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 872 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 856 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 856 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.88 
 
 		 858 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 		 904 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  40.24 
 
 		 863 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 856 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 928 aa  591  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 897 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  37.94 
 
 		 891 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 872 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 857 aa  589  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 861 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 		 870 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 851 aa  586  1e-166  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 		 894 aa  587  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 856 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 		 872 aa  586  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 		 856 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.62 
 
 		 872 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 858 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 881 aa  586  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 862 aa  588  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 		 854 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 882 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 		 869 aa  582  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 868 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 886 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 		 860 aa  583  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 840 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.61 
 
 		 858 aa  580  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 		 894 aa  579  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 927 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 863 aa  579  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 		 848 aa  579  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  38.52 
 
 		 852 aa  579  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 892 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 892 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 890 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 881 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 		 874 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 892 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 892 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 890 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 892 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 854 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.13 
 
 		 856 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 861 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 868 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 		 882 aa  575  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 871 aa  575  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 823 aa  575  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 		 918 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 		 859 aa  575  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 		 854 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>