More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1024 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  67.29 
 
 		 694 aa  816    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  65.68 
 
 		 665 aa  733    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  62.55 
 
 		 739 aa  801    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  67.24 
 
 		 688 aa  830    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 664 aa  1271    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  36.26 
 
 		 719 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  34.23 
 
 		 700 aa  352  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.29 
 
 		 678 aa  317  4e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.62 
 
 		 595 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.6 
 
 		 589 aa  157  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  42.7 
 
 		 583 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.88 
 
 		 618 aa  147  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  48.09 
 
 		 641 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  28.63 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.45 
 
 		 648 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  28.05 
 
 		 793 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  30.56 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  34.01 
 
 		 788 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  27.48 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  26.32 
 
 		 792 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  28.05 
 
 		 778 aa  74.7  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 881 aa  74.7  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.69 
 
 		 771 aa  73.9  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  28.76 
 
 		 782 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  35.03 
 
 		 897 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  30.23 
 
 		 784 aa  72  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  29.2 
 
 		 804 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  31.56 
 
 		 907 aa  71.2  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  34.43 
 
 		 881 aa  70.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.55 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.9 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.87 
 
 		 784 aa  70.9  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 775 aa  70.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  26.14 
 
 		 869 aa  70.5  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1218  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.31 
 
 		 654 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  34.23 
 
 		 911 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.87 
 
 		 782 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  28.7 
 
 		 805 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6754  predicted protein  29.85 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0784  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.04 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  31.74 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  32.42 
 
 		 789 aa  68.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  32.38 
 
 		 785 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  32.54 
 
 		 905 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  27.91 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  29.21 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  32.06 
 
 		 851 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  34.39 
 
 		 910 aa  68.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  29.67 
 
 		 824 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  26.36 
 
 		 855 aa  68.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  29.78 
 
 		 882 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  26.42 
 
 		 863 aa  68.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  28.18 
 
 		 820 aa  67.8  0.0000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 907 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  27.19 
 
 		 927 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  30.91 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 851 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  25.88 
 
 		 780 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  36.88 
 
 		 863 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.44 
 
 		 791 aa  67  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 861 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.96 
 
 		 782 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  30.86 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  35.46 
 
 		 858 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 851 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  28.65 
 
 		 862 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  27.66 
 
 		 812 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.76 
 
 		 776 aa  65.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  29.22 
 
 		 779 aa  66.2  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  30.8 
 
 		 854 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  35.46 
 
 		 858 aa  65.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  23.69 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  28.12 
 
 		 856 aa  65.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  31.7 
 
 		 863 aa  65.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 856 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  26.24 
 
 		 859 aa  65.1  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  27.15 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  30.46 
 
 		 785 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52173  muts-like protein 5  26.21 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47730  predicted protein  29.02 
 
 		 1085 aa  64.7  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  30.3 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  27.87 
 
 		 898 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  28.12 
 
 		 861 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  27.39 
 
 		 853 aa  64.3  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  32.2 
 
 		 859 aa  64.3  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  23.88 
 
 		 863 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  28.94 
 
 		 893 aa  63.9  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  27.78 
 
 		 783 aa  64.3  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  30.15 
 
 		 861 aa  63.9  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.11 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.47 
 
 		 792 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  26.58 
 
 		 769 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  32.47 
 
 		 868 aa  63.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  29.05 
 
 		 846 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  26.64 
 
 		 806 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  33.16 
 
 		 916 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  28.39 
 
 		 765 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 868 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>