More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2159 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0784  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  68.28 
 
 		 529 aa  687    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 522 aa  1046    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0891  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  48.74 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0744  MutS domain V protein  48.74 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  32.63 
 
 		 791 aa  279  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  35.8 
 
 		 775 aa  273  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  34.7 
 
 		 789 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  37.16 
 
 		 750 aa  266  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  32.68 
 
 		 779 aa  265  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  33.72 
 
 		 782 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.27 
 
 		 784 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  31.44 
 
 		 787 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  35.47 
 
 		 786 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  34.42 
 
 		 804 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  34.55 
 
 		 794 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  36.43 
 
 		 801 aa  256  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  32.37 
 
 		 805 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  37.5 
 
 		 761 aa  251  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.37 
 
 		 723 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  34.74 
 
 		 788 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.03 
 
 		 792 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  34.56 
 
 		 784 aa  246  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.31 
 
 		 791 aa  246  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  32.57 
 
 		 791 aa  244  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  31.43 
 
 		 780 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.91 
 
 		 782 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.83 
 
 		 705 aa  240  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.57 
 
 		 786 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  30.13 
 
 		 796 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  34.65 
 
 		 803 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.17 
 
 		 786 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  27.62 
 
 		 763 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  32.14 
 
 		 793 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  32.63 
 
 		 796 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  33.01 
 
 		 785 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  31.19 
 
 		 797 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  31.23 
 
 		 796 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  36.06 
 
 		 789 aa  236  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  30.69 
 
 		 792 aa  234  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  31.92 
 
 		 800 aa  234  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.51 
 
 		 783 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  32.32 
 
 		 783 aa  233  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.79 
 
 		 786 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  30.06 
 
 		 793 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.79 
 
 		 786 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.79 
 
 		 786 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  35.82 
 
 		 780 aa  229  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.6 
 
 		 786 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.6 
 
 		 786 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.6 
 
 		 786 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.6 
 
 		 786 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  33.91 
 
 		 788 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.34 
 
 		 782 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.34 
 
 		 782 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  32.76 
 
 		 791 aa  227  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  35.8 
 
 		 826 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.37 
 
 		 786 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.37 
 
 		 786 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  28.46 
 
 		 792 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.41 
 
 		 786 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 		 633 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.41 
 
 		 786 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  32.06 
 
 		 820 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  27.27 
 
 		 633 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  27.08 
 
 		 633 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  27.08 
 
 		 633 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  34.17 
 
 		 785 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  27.08 
 
 		 633 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  27.08 
 
 		 633 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.25 
 
 		 782 aa  223  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  33.42 
 
 		 757 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  33.42 
 
 		 757 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  32.77 
 
 		 806 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  28.71 
 
 		 722 aa  223  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  32.44 
 
 		 812 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  33.59 
 
 		 824 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  26.89 
 
 		 633 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  30.71 
 
 		 840 aa  220  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  34.12 
 
 		 828 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  26.89 
 
 		 633 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  27.08 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  29.09 
 
 		 802 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  32.13 
 
 		 785 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.89 
 
 		 633 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.15 
 
 		 633 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  28.24 
 
 		 757 aa  216  5.9999999999999996e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.63 
 
 		 648 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1972  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.77 
 
 		 774 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.656834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2338  MutS2 family protein  34.77 
 
 		 774 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  36.94 
 
 		 793 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  29.09 
 
 		 778 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.51 
 
 		 796 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  36.26 
 
 		 818 aa  213  7.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  29.58 
 
 		 794 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.87 
 
 		 798 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  33.81 
 
 		 792 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.56 
 
 		 721 aa  210  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  29.07 
 
 		 803 aa  210  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.94 
 
 		 803 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  29.34 
 
 		 803 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>