More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2680 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  100 
 
 		 788 aa  1571    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  35.51 
 
 		 791 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  38.97 
 
 		 786 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  36.44 
 
 		 792 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  37.16 
 
 		 789 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.95 
 
 		 786 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  34.45 
 
 		 793 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  34.93 
 
 		 796 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.95 
 
 		 786 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.95 
 
 		 786 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.95 
 
 		 786 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.82 
 
 		 786 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.27 
 
 		 786 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.82 
 
 		 786 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.82 
 
 		 786 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.82 
 
 		 786 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.77 
 
 		 786 aa  466  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.38 
 
 		 784 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  37.52 
 
 		 782 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.7 
 
 		 786 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  34.36 
 
 		 796 aa  452  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.44 
 
 		 786 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.32 
 
 		 786 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  34.28 
 
 		 781 aa  443  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  38.14 
 
 		 794 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.97 
 
 		 782 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  36.26 
 
 		 792 aa  439  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  38.48 
 
 		 775 aa  439  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.04 
 
 		 782 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.55 
 
 		 782 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.17 
 
 		 791 aa  432  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  37.56 
 
 		 801 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.55 
 
 		 782 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  37.11 
 
 		 784 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  34.56 
 
 		 785 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  35.54 
 
 		 785 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.42 
 
 		 792 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  35.7 
 
 		 806 aa  419  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  34.97 
 
 		 788 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  35.34 
 
 		 828 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  33.83 
 
 		 791 aa  409  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  33.21 
 
 		 800 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  36.76 
 
 		 804 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  35.72 
 
 		 826 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.93 
 
 		 776 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  32.88 
 
 		 783 aa  406  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  31.3 
 
 		 787 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  33.04 
 
 		 778 aa  402  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  33.83 
 
 		 783 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  33.29 
 
 		 783 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  32.03 
 
 		 795 aa  401  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  35.73 
 
 		 820 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  33.58 
 
 		 804 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  29.13 
 
 		 779 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  32.31 
 
 		 791 aa  393  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  33.89 
 
 		 802 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  32.21 
 
 		 785 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  29.82 
 
 		 763 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  31.95 
 
 		 779 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.05 
 
 		 798 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  32.96 
 
 		 796 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  36.23 
 
 		 771 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  29.32 
 
 		 780 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  32.73 
 
 		 805 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  35.83 
 
 		 789 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.32 
 
 		 830 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  31.97 
 
 		 794 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.4 
 
 		 830 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  33.75 
 
 		 793 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  33.84 
 
 		 776 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  33.75 
 
 		 765 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  31.74 
 
 		 757 aa  364  4e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  31.74 
 
 		 757 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  32.11 
 
 		 825 aa  359  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  34.29 
 
 		 761 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  32.14 
 
 		 793 aa  356  8.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.52 
 
 		 803 aa  356  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  33.29 
 
 		 780 aa  355  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.17 
 
 		 793 aa  355  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  30.92 
 
 		 797 aa  353  8.999999999999999e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  30 
 
 		 792 aa  351  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  31.28 
 
 		 840 aa  349  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 812 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  33.97 
 
 		 824 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  33.66 
 
 		 767 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.33 
 
 		 857 aa  344  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.04 
 
 		 771 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.4 
 
 		 796 aa  341  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.54 
 
 		 789 aa  335  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  28.75 
 
 		 803 aa  333  8e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  34.06 
 
 		 799 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  29.18 
 
 		 818 aa  332  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2338  MutS2 family protein  33.62 
 
 		 774 aa  332  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1972  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.62 
 
 		 774 aa  332  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.656834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  35.21 
 
 		 633 aa  331  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02951  DNA mismatch repair protein MutS family protein  30.11 
 
 		 804 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0619291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1585  MutS 2 protein  30.11 
 
 		 804 aa  330  6e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  33.88 
 
 		 750 aa  329  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1826  MutS 2 protein  34.85 
 
 		 814 aa  329  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.64 
 
 		 633 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>