More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3301 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  59.98 
 
 
830 aa  998    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  59.51 
 
 
825 aa  992    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  60.63 
 
 
798 aa  1024    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  60.05 
 
 
803 aa  996    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  60.09 
 
 
830 aa  1001    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  51.11 
 
 
796 aa  808    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  57.56 
 
 
818 aa  915    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  100 
 
 
857 aa  1742    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  42.17 
 
 
799 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  41.2 
 
 
828 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1826  MutS 2 protein  43.47 
 
 
814 aa  601  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1585  MutS 2 protein  39.37 
 
 
804 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02951  DNA mismatch repair protein MutS family protein  39.25 
 
 
804 aa  585  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0619291  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  40.7 
 
 
805 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  34.49 
 
 
803 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  33.95 
 
 
803 aa  479  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  33.26 
 
 
803 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  33.37 
 
 
803 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  34.89 
 
 
826 aa  459  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.41 
 
 
784 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.44 
 
 
786 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  37.55 
 
 
789 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.79 
 
 
786 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.2 
 
 
786 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.9 
 
 
786 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.9 
 
 
786 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.02 
 
 
786 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.9 
 
 
786 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.9 
 
 
786 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.02 
 
 
786 aa  446  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  34.24 
 
 
791 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.09 
 
 
786 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  35.02 
 
 
828 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.79 
 
 
786 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  36.44 
 
 
801 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  34.05 
 
 
793 aa  436  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  33.22 
 
 
792 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  35.86 
 
 
806 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  33.14 
 
 
796 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  33.64 
 
 
791 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  33.63 
 
 
786 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.97 
 
 
792 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.96 
 
 
782 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  33.41 
 
 
820 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  34.02 
 
 
782 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.96 
 
 
782 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  32.49 
 
 
787 aa  406  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  33.67 
 
 
796 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.91 
 
 
791 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  32.83 
 
 
776 aa  392  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.14 
 
 
782 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  32.16 
 
 
800 aa  383  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  33.06 
 
 
794 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  31.78 
 
 
778 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  32.3 
 
 
784 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.92 
 
 
786 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.69 
 
 
786 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.09 
 
 
782 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  32.25 
 
 
776 aa  369  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.49 
 
 
783 aa  365  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  30.61 
 
 
824 aa  364  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  31.04 
 
 
781 aa  361  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  31.96 
 
 
779 aa  344  5e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  30.67 
 
 
779 aa  344  5e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  29.81 
 
 
795 aa  340  5e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  30.57 
 
 
791 aa  340  5.9999999999999996e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  29.04 
 
 
780 aa  339  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  31.05 
 
 
775 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  30.84 
 
 
789 aa  328  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  30.01 
 
 
792 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  30.37 
 
 
788 aa  325  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  33.04 
 
 
804 aa  321  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  29.34 
 
 
785 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  30.81 
 
 
761 aa  314  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  29.44 
 
 
750 aa  308  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  29.64 
 
 
757 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  29.64 
 
 
757 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  28.15 
 
 
804 aa  300  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  29.04 
 
 
783 aa  298  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  27.18 
 
 
803 aa  294  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  28.02 
 
 
785 aa  294  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  28.73 
 
 
785 aa  293  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  29.14 
 
 
783 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  29.78 
 
 
818 aa  292  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  28.3 
 
 
805 aa  286  9e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  32.06 
 
 
812 aa  285  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  29.3 
 
 
805 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  27.54 
 
 
788 aa  280  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  30.16 
 
 
780 aa  280  8e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  27.63 
 
 
760 aa  280  9e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  28.21 
 
 
763 aa  280  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  28.3 
 
 
765 aa  278  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  31.4 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37894  predicted protein  34.29 
 
 
502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.525832 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  26.87 
 
 
793 aa  273  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  32.76 
 
 
572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  28.74 
 
 
797 aa  271  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  31.72 
 
 
633 aa  270  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  32.18 
 
 
633 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  30.89 
 
 
633 aa  269  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>