More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0230 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  46.35 
 
 
784 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  100 
 
 
789 aa  1585    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  44.5 
 
 
793 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  48.06 
 
 
801 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  44.67 
 
 
792 aa  649    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  48.24 
 
 
782 aa  699    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  47.8 
 
 
786 aa  705    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  45.38 
 
 
784 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  42.18 
 
 
796 aa  606  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43.84 
 
 
786 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43.16 
 
 
782 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43.47 
 
 
786 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43.34 
 
 
786 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.98 
 
 
791 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.84 
 
 
786 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.84 
 
 
786 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.6 
 
 
792 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.71 
 
 
786 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.95 
 
 
786 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.82 
 
 
786 aa  594  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.95 
 
 
786 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.59 
 
 
786 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.71 
 
 
786 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  40.84 
 
 
796 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.71 
 
 
786 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.59 
 
 
786 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  39.75 
 
 
787 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  40.05 
 
 
791 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.64 
 
 
782 aa  548  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.12 
 
 
782 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.12 
 
 
782 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  40.42 
 
 
806 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  38.69 
 
 
781 aa  532  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  40.98 
 
 
775 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  39.76 
 
 
828 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  39.56 
 
 
820 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  40.17 
 
 
826 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  40.64 
 
 
794 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  36.8 
 
 
791 aa  495  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  37.42 
 
 
791 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  37.48 
 
 
800 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  38.18 
 
 
780 aa  487  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  36.28 
 
 
795 aa  470  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  38 
 
 
776 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  33.67 
 
 
779 aa  463  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  37.16 
 
 
788 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  35.47 
 
 
778 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  37.64 
 
 
804 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.76 
 
 
830 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.76 
 
 
830 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.55 
 
 
857 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  35.87 
 
 
757 aa  433  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  35.99 
 
 
757 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  34.74 
 
 
776 aa  434  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.18 
 
 
798 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.35 
 
 
818 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.01 
 
 
803 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  34.32 
 
 
779 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  33 
 
 
785 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  34.54 
 
 
783 aa  413  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  34.37 
 
 
825 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  33.42 
 
 
792 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  34.09 
 
 
783 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  33.79 
 
 
783 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  35.41 
 
 
785 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.43 
 
 
796 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  32.17 
 
 
792 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  36.11 
 
 
788 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  32.88 
 
 
805 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  35.13 
 
 
789 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  36.04 
 
 
780 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  32.16 
 
 
824 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  32.38 
 
 
805 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  32.79 
 
 
797 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  33.21 
 
 
828 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  31.35 
 
 
803 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1585  MutS 2 protein  32.34 
 
 
804 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02951  DNA mismatch repair protein MutS family protein  32.47 
 
 
804 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0619291  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  33.54 
 
 
785 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  30.81 
 
 
804 aa  376  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  33.13 
 
 
802 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  31.71 
 
 
793 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  33.29 
 
 
799 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.77 
 
 
633 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1826  MutS 2 protein  35.22 
 
 
814 aa  363  6e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  30.52 
 
 
763 aa  362  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  31.38 
 
 
840 aa  360  8e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  34.22 
 
 
750 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  35.35 
 
 
633 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  35.87 
 
 
633 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  35.55 
 
 
633 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  35.55 
 
 
633 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  35.55 
 
 
633 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  36.06 
 
 
633 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  35.16 
 
 
633 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  31.24 
 
 
796 aa  355  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  33.62 
 
 
818 aa  354  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  35.48 
 
 
633 aa  354  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  36.26 
 
 
572 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  29.84 
 
 
803 aa  353  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>