More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1638 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.32 
 
 		 786 aa  661    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  49.18 
 
 		 792 aa  639    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.83 
 
 		 786 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.57 
 
 		 786 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.7 
 
 		 786 aa  664    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.7 
 
 		 786 aa  664    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  59 
 
 		 786 aa  933    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.71 
 
 		 786 aa  674    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.7 
 
 		 786 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.19 
 
 		 786 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  48.24 
 
 		 789 aa  712    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  50.83 
 
 		 784 aa  767    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.57 
 
 		 786 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  48.39 
 
 		 801 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  48.54 
 
 		 784 aa  677    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  48.23 
 
 		 793 aa  725    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  45.57 
 
 		 786 aa  646    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  45.7 
 
 		 786 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  47.2 
 
 		 791 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  44.26 
 
 		 796 aa  660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  100 
 
 		 782 aa  1588    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  48.11 
 
 		 792 aa  710    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.95 
 
 		 786 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.83 
 
 		 786 aa  665    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  43.21 
 
 		 796 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  42.14 
 
 		 787 aa  612  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  45.08 
 
 		 775 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43.69 
 
 		 782 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  42.07 
 
 		 791 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  42.97 
 
 		 806 aa  575  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.98 
 
 		 782 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.98 
 
 		 782 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.61 
 
 		 782 aa  558  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  41.98 
 
 		 794 aa  558  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  40.72 
 
 		 826 aa  545  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  39.87 
 
 		 781 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  40.07 
 
 		 820 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  38.7 
 
 		 791 aa  531  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  39.34 
 
 		 800 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  40.71 
 
 		 828 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  40.96 
 
 		 778 aa  525  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  39.47 
 
 		 776 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  38.55 
 
 		 791 aa  511  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  38.6 
 
 		 776 aa  489  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  37.2 
 
 		 795 aa  484  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  35.58 
 
 		 779 aa  481  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  35.83 
 
 		 780 aa  478  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  38.07 
 
 		 804 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.87 
 
 		 830 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.99 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  37.45 
 
 		 783 aa  463  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  37.52 
 
 		 788 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  37.22 
 
 		 779 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  34.09 
 
 		 805 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.9 
 
 		 803 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  35.38 
 
 		 785 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  35.88 
 
 		 792 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  37.6 
 
 		 789 aa  430  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  37.01 
 
 		 812 aa  429  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  35.57 
 
 		 757 aa  425  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  35.57 
 
 		 757 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  36.1 
 
 		 761 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  33.92 
 
 		 802 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.47 
 
 		 798 aa  419  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.02 
 
 		 857 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  35.34 
 
 		 783 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  34.24 
 
 		 825 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  35.46 
 
 		 783 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  35.74 
 
 		 750 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  33.75 
 
 		 785 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  33.12 
 
 		 794 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.71 
 
 		 796 aa  402  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  31.49 
 
 		 792 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  32.78 
 
 		 763 aa  402  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  35.12 
 
 		 788 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.1 
 
 		 818 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  32.87 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  34.75 
 
 		 785 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  31.15 
 
 		 804 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  32.67 
 
 		 793 aa  389  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  31.73 
 
 		 840 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  31.76 
 
 		 824 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  37.8 
 
 		 633 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 		 633 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 		 633 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  32.35 
 
 		 796 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  33.79 
 
 		 793 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  37.6 
 
 		 633 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  37.6 
 
 		 633 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.96 
 
 		 633 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  37.4 
 
 		 633 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  37.2 
 
 		 633 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  37.2 
 
 		 633 aa  379  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.36 
 
 		 633 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  37.6 
 
 		 572 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  34.02 
 
 		 760 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  33.76 
 
 		 780 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  33.83 
 
 		 828 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  32.52 
 
 		 803 aa  372  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  32.08 
 
 		 771 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>