More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2648 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  45.13 
 
 		 805 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  43.98 
 
 		 802 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  100 
 
 		 797 aa  1621    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  39.95 
 
 		 792 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  37.02 
 
 		 840 aa  544  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  34.2 
 
 		 804 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.01 
 
 		 705 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 794 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  31.99 
 
 		 791 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  34 
 
 		 804 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  34.79 
 
 		 793 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.9 
 
 		 782 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  33.79 
 
 		 793 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.03 
 
 		 784 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  31.37 
 
 		 791 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  33.46 
 
 		 796 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  33.12 
 
 		 782 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  31.41 
 
 		 787 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.73 
 
 		 782 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.26 
 
 		 791 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  32.79 
 
 		 789 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.73 
 
 		 782 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.21 
 
 		 782 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  31.49 
 
 		 784 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  32.38 
 
 		 792 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  31.45 
 
 		 793 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  30.53 
 
 		 826 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  32.5 
 
 		 786 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  33.25 
 
 		 794 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.09 
 
 		 786 aa  365  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.53 
 
 		 786 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.74 
 
 		 786 aa  364  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.74 
 
 		 786 aa  364  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.53 
 
 		 786 aa  363  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.62 
 
 		 786 aa  363  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.62 
 
 		 786 aa  363  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.28 
 
 		 786 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.49 
 
 		 786 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.49 
 
 		 786 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.82 
 
 		 721 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.08 
 
 		 793 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.62 
 
 		 792 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  30.41 
 
 		 828 aa  357  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.42 
 
 		 786 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  31.27 
 
 		 791 aa  355  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.23 
 
 		 783 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  30.75 
 
 		 796 aa  352  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.67 
 
 		 789 aa  351  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  31.44 
 
 		 783 aa  351  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.91 
 
 		 750 aa  350  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  32.45 
 
 		 796 aa  347  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  30.63 
 
 		 801 aa  345  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  30.47 
 
 		 776 aa  345  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  35.16 
 
 		 722 aa  344  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  30.92 
 
 		 788 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.88 
 
 		 723 aa  344  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  31.1 
 
 		 781 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  30.08 
 
 		 775 aa  336  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  31.03 
 
 		 779 aa  335  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  30 
 
 		 820 aa  333  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  29.94 
 
 		 795 aa  333  1e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  32.69 
 
 		 778 aa  332  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  30.71 
 
 		 800 aa  331  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  29.98 
 
 		 792 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  29.63 
 
 		 785 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  30.42 
 
 		 780 aa  328  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  29.96 
 
 		 806 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  29.65 
 
 		 788 aa  327  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  32.79 
 
 		 757 aa  325  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  32.79 
 
 		 757 aa  325  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  31.25 
 
 		 812 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.57 
 
 		 783 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  31.53 
 
 		 789 aa  322  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  28.88 
 
 		 779 aa  319  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.16 
 
 		 786 aa  318  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.16 
 
 		 786 aa  317  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  27.7 
 
 		 785 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  29.28 
 
 		 785 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  29.8 
 
 		 763 aa  313  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  32.32 
 
 		 761 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  30.86 
 
 		 776 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  29.88 
 
 		 803 aa  301  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  29.76 
 
 		 780 aa  296  8e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.04 
 
 		 830 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  30.97 
 
 		 760 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.13 
 
 		 830 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.46 
 
 		 803 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  29.4 
 
 		 824 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  29.52 
 
 		 780 aa  276  1.0000000000000001e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  27.75 
 
 		 757 aa  276  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  29.43 
 
 		 765 aa  271  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.75 
 
 		 798 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  29.67 
 
 		 803 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.07 
 
 		 796 aa  267  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  26.63 
 
 		 818 aa  266  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  29.25 
 
 		 803 aa  266  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  29.72 
 
 		 803 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.31 
 
 		 771 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.74 
 
 		 857 aa  262  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  29.79 
 
 		 771 aa  260  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>