More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0219 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  91.41 
 
 
803 aa  1444    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  75.22 
 
 
803 aa  1253    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1585  MutS 2 protein  47.2 
 
 
804 aa  763    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02951  DNA mismatch repair protein MutS family protein  47.07 
 
 
804 aa  764    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0619291  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1826  MutS 2 protein  43.35 
 
 
814 aa  645    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  43.8 
 
 
799 aa  691    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  100 
 
 
803 aa  1607    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  43.13 
 
 
828 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  47.04 
 
 
805 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  91.53 
 
 
803 aa  1466    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.04 
 
 
818 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.78 
 
 
830 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.98 
 
 
803 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.78 
 
 
830 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.42 
 
 
798 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  36.36 
 
 
825 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.99 
 
 
796 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.49 
 
 
857 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  30.75 
 
 
791 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.78 
 
 
782 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.78 
 
 
782 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  30.91 
 
 
789 aa  346  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.01 
 
 
782 aa  338  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.8 
 
 
784 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  31.6 
 
 
791 aa  337  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  31.17 
 
 
786 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  31.27 
 
 
796 aa  332  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.08 
 
 
786 aa  331  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30 
 
 
786 aa  330  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  29.42 
 
 
784 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.08 
 
 
786 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.05 
 
 
782 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.08 
 
 
786 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.96 
 
 
786 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.84 
 
 
786 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.84 
 
 
786 aa  327  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.96 
 
 
786 aa  327  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  29.4 
 
 
826 aa  326  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.84 
 
 
786 aa  325  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.84 
 
 
786 aa  325  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.96 
 
 
786 aa  324  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  30.86 
 
 
778 aa  324  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  30.07 
 
 
792 aa  324  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  30.58 
 
 
794 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.54 
 
 
792 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  28.92 
 
 
800 aa  314  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.9 
 
 
786 aa  313  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.78 
 
 
786 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  30.64 
 
 
782 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  29.29 
 
 
828 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  27.48 
 
 
776 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  29.75 
 
 
783 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  29 
 
 
785 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  31.76 
 
 
787 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  27.55 
 
 
788 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  30.11 
 
 
793 aa  302  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  30.42 
 
 
776 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  27.86 
 
 
820 aa  300  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  29.1 
 
 
806 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  28.17 
 
 
801 aa  297  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  29.14 
 
 
791 aa  297  6e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  27.23 
 
 
824 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  28.85 
 
 
785 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  28.55 
 
 
792 aa  295  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  29.64 
 
 
779 aa  295  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.68 
 
 
791 aa  295  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  27.81 
 
 
783 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  28.43 
 
 
783 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  29.09 
 
 
804 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  30.72 
 
 
779 aa  292  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  29.58 
 
 
796 aa  290  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  27.62 
 
 
785 aa  286  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  28.37 
 
 
750 aa  283  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  29.94 
 
 
781 aa  283  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  28.87 
 
 
780 aa  280  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  29.27 
 
 
795 aa  279  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  28.36 
 
 
761 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 
633 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  27.47 
 
 
793 aa  272  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  29.04 
 
 
789 aa  272  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  27.17 
 
 
794 aa  272  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  30.12 
 
 
757 aa  272  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  29.99 
 
 
757 aa  271  4e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  29.72 
 
 
797 aa  271  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  26.85 
 
 
788 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  28.61 
 
 
775 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  27.14 
 
 
804 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  26.32 
 
 
792 aa  263  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  32.17 
 
 
633 aa  263  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  32.56 
 
 
803 aa  263  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  32.17 
 
 
633 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  27.38 
 
 
793 aa  260  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  32.17 
 
 
633 aa  260  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  32.17 
 
 
633 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  32.17 
 
 
633 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  31.98 
 
 
633 aa  258  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  32.17 
 
 
633 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  31.14 
 
 
760 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.59 
 
 
633 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  28.07 
 
 
805 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>